[发明专利]一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用有效
| 申请号： | 201510867756.0 | 申请日： | 2015-11-30 |
| 公开（公告）号： | CN105349674B | 公开（公告）日： | 2019-05-17 |
| 发明（设计）人： | 陈宏;刘梅;李波;徐瑶;蓝贤勇;黄永震;白跃宇 | 申请（专利权）人： | 西北农林科技大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6827 | 分类号： | C12Q1/6827;C12Q1/686;C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人： | 陆万寿 |
| 地址： | 712100 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用：所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr 4:118264951‑118267170的拷贝数变异，该检测方法是以秦川牛的基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异。本发明可在DNA水平上检测与秦川牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为秦川牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 秦川 生长 相关 cnv 标记 检测 方法 应用 | ||
【主权项】：
1.一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：以秦川牛基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3，根据定量结果鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异，其中插入型个体的生长性状显著高于缺失型个体；所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr4:118264951‑118267170的拷贝数变异；所述秦川牛SHH基因CNV区域的扩增引物对为：上游引物F1：5′‑CGCACGCAATGAGACTTTA‑3′，下游引物R1：5′‑AATAGCCAGGAGAGGTGAA‑3′。
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