[发明专利]SNP位点基因型分型的方法有效
| 申请号： | 201510869867.5 | 申请日： | 2013-07-16 |
| 公开（公告）号： | CN105331729B | 公开（公告）日： | 2019-01-11 |
| 发明（设计）人： | 张德强;徐煲铧;杜庆章 | 申请（专利权）人： | 北京林业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 赵囡囡;金田蕴 |
| 地址： | 100083 北京市海淀*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。 | ||
| 搜索关键词： | snp 基因型 方法 | ||
【主权项】：
1.一种SNP位点基因型分型的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对所述SNP位点设计PCR扩增引物，所述PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应所述待测SNP位点，将对应所述待测SNP位点的所述3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用所述PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定所述待测样本的SNP位点基因型；所述待测样本为毛白杨，所述待测SNP位点位于纤维素合酶基因5上，所述PCR扩增引物的碱基序列为SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6；所述SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6的3'末端上的倒数第一个核苷酸进行LNA修饰。
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