[发明专利]一种蛋白质模板库的扩充方法及装置有效
| 申请号： | 201510938160.5 | 申请日： | 2015-12-15 |
| 公开（公告）号： | CN105574359B | 公开（公告）日： | 2018-09-14 |
| 发明（设计）人： | 董启文 | 申请（专利权）人： | 上海珍岛信息技术有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/16 | 分类号： | G06F19/16 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 罗满 |
| 地址： | 200083 上海市虹*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种蛋白质模板库的扩充方法及装置，包括：从已知结构的原始蛋白质模板库中选择初始蛋白质样本，并通过序列对比算法去除初始蛋白质样本中相似度较高的蛋白质序列，将最终保留的蛋白质序列作为蛋白质样本；通过蛋白质分子设计算法，设计与蛋白质样本相对应的蛋白质序列，并将设计的蛋白质序列加入原始蛋白质模板库，生成初始扩充蛋白质模板库；通过序列对比算法去除初始扩充蛋白质样本中相似度较高的蛋白质序列，将最终保留的蛋白质序列作为扩充蛋白质模板库，可见，在本实施例中，通过对筛选的蛋白质样本进行设计，能扩充现有蛋白质模板库，增加模板库中蛋白质序列的数量，从而提高蛋白质结构预测的精度及准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 蛋白质 模板 扩充 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种蛋白质模板库的扩充方法，其特征在于，包括：从已知结构的原始蛋白质模板库中选择初始蛋白质样本，并通过序列对比算法去除所述初始蛋白质样本中相似度较高的蛋白质序列，将最终保留的蛋白质序列作为蛋白质样本；通过蛋白质分子设计算法，设计与所述蛋白质样本相对应的蛋白质序列，并将设计的蛋白质序列加入所述原始蛋白质模板库，生成初始扩充蛋白质模板库；通过序列对比算法去除所述初始扩充蛋白质模板库中相似度较高的蛋白质序列，将最终保留的蛋白质序列作为扩充蛋白质模板库。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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