[发明专利]一种环境微生物基因组草图的构建方法有效
| 申请号： | 201510983092.4 | 申请日： | 2015-12-24 |
| 公开（公告）号： | CN105420375B | 公开（公告）日： | 2020-01-21 |
| 发明（设计）人： | 万成;文平;陆祖宏;康玉麟 | 申请（专利权）人： | 北京大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6806 | 分类号： | C12Q1/6806;G16B40/00 |
| 代理公司： | 11360 北京万象新悦知识产权代理有限公司 | 代理人： | 李稚婷 |
| 地址： | 100871*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于微量细胞全基因组测序的环境微生物基因组草图的构建方法，通过对多个环境微生物微小宏基因组样本分别进行核酸分离，扩增，构建高通测序文库，然后对测序数据进行过滤、从头组装、开放阅读框预测，使用基于隐马尔科夫模型的算法将序列分类，获得微生物基因组草图。该方法根据环境样本微生物群落的复杂度调整平行试验的次数，以获得最优的分析结果，可应用于土壤、空气、水体、人体等各种环境的微生物群落研究。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 环境 微生物 基因组 草图 构建 方法 | ||
【主权项】：
1.一种环境微生物基因组草图的构建方法，包括以下步骤：/n1)采集环境微生物样品，根据下述公式1确定单次测序平行实验所需的细胞数N及平行实验的次数X：/n公式1：
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