[发明专利]用于产生双链DNA文库的方法和用于鉴定甲基化胞嘧啶的测序方法在审

专利信息
申请号: 201580012375.2 申请日: 2015-01-07
公开(公告)号: CN106103743A 公开(公告)日: 2016-11-09
发明(设计)人: 劳伦克·科尔·穆莱特;米格尔·A·佩纳杜·莫瑞丝 申请(专利权)人: IMPPC私人基金会;劳伦克·科尔·穆莱特
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 代理人: 肖善强
地址: 西班牙*** 国省代码: 西班牙;ES
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摘要: 发明涉及用于鉴定双链DNA分子群体中的甲基化胞嘧啶的方法。本发明还涉及适配子和用于合成所述适配子的试剂盒以及涉及通过本发明的方法获得的双链DNA文库。
搜索关键词: 用于 产生 dna 文库 方法 鉴定 甲基化 胞嘧啶
【主权项】:
一种用于鉴定双链DNA分子群体中的甲基化胞嘧啶的方法,所述方法包括以下步骤:(i)使双链DNA衔接子与多个双链DNA分子的链的至少一个末端连接,并且使多个双链DNA分子的链配对以提供多个配对的经衔接子修饰的DNA分子;(ii)将所述配对的经衔接子修饰的DNA分子中的任何(非甲基化)胞嘧啶转化成所述配对的经衔接子修饰的DNA分子中的尿嘧啶;(iii)使用核苷酸A、G、C和T和引物提供配对的且经转化的经衔接子修饰的DNA分子的互补链,所述引物的序列与所述双链衔接子的至少一部分互补以提供部分转化的配对的双链分子;(iv)任选地,扩增步骤(iii)中获得的所述部分转化的配对的双链DNA分子以提供扩增的配对的双链DNA分子;(v)对步骤(iii)中或步骤(iv)中获得的所述配对的DNA分子测序,其中若步骤(iii)中或步骤(iv)中获得的所述配对的双链DNA分子的链之一中出现胞嘧啶并且所述配对的双链DNA分子的另一条链中的相应位置中出现鸟嘌呤,则确定给定位置处的甲基化胞嘧啶的存在,和/或其中若步骤(iii)中或步骤(iv)中获得的所述配对的双链DNA分子的链之一中出现尿嘧啶或胸腺嘧啶并且所述配对的双链DNA分子的另一条链中的相应位置中出现鸟嘌呤,则确定给定位置处的非甲基化胞嘧啶的存在。
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