[发明专利]变构蛋白的从头设计在审

专利信息
申请号: 201580019972.8 申请日: 2015-02-20
公开(公告)号: CN106232827A 公开(公告)日: 2016-12-14
发明(设计)人: G·M·丘奇;S·拉曼;N·D·泰勒 申请(专利权)人: 哈佛学院董事及会员团体
主分类号: C12P21/08 分类号: C12P21/08;C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司31100 代理人: 杨昀;陶家蓉
地址: 美国马萨*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 用于制备和分离结合至一种或多种变构效应物以诱导所述蛋白质中的构象变化的变构DNA结合蛋白的方法和组合物。
搜索关键词: 蛋白 从头 设计
【主权项】:
一种制备和分离变构DNA结合蛋白的方法,所述变构DNA结合蛋白结合至侣伴变构效应物,其诱导构象变化,所述方法包括:以计算机模拟的方式通过计算设计候选变构DNA结合蛋白,其具有针对侣伴变构效应物的结合口袋,提供编码所述候选变构DNA结合蛋白的核酸序列,将所述核酸序列引入细菌宿主细胞,并表达所述候选变构DNA结合蛋白,采用负选择来鉴定其中候选变构DNA结合蛋白已结合至DNA并抑制基因表达的第一多个细菌宿主细胞,从而确定所述候选变构DNA结合蛋白是否结合至DNA并抑制所述基因的表达,和采用正选择来鉴定其中所述候选变构DNA结合蛋白已结合至所述侣伴变构效应物的第二多个细菌宿主细胞,从而确定第一多个细菌宿主细胞中的所述候选变构DNA结合蛋白是否结合至所述侣伴变构效应物。
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