[发明专利]用于使用网络失调鉴定药物作用机制的方法和系统有效
申请号: | 201580024241.2 | 申请日: | 2015-05-11 |
公开(公告)号: | CN106662567B | 公开(公告)日: | 2019-11-19 |
发明(设计)人: | A·卡利法诺;M·班索;Y·希莫尼 | 申请(专利权)人: | 纽约市哥伦比亚大学理事会 |
主分类号: | G16C20/10 | 分类号: | G16C20/10;G16B5/00;G16B40/00 |
代理公司: | 11038 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 张小勇<国际申请>=PCT/US2015 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 本文公开了使用网络失调来鉴定化合物的作用机制的技术。示例性方法可包括选择涉及至少第一基因的至少第一相互作用,测定第一基因和处于对照状态中的一个或多个基因的基因表达水平的第一n维概率密度,测定在使用至少一种化合物处理后所述第一基因和一个或多个基因的基因表达水平的第二n维概率密度,估算第一概率密度与第二概率密度之间的变化,以及确定所估算的变化是否是统计上显著的。 | ||
搜索关键词: | 用于 使用 网络 失调 鉴定 药物 作用 机制 方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种使用网络失调来鉴定治疗化合物的作用机制的方法,其包括:/n(a)选择具有多个相互作用的组织特异性调控网络,每个相互作用连接基因对;/n(b)使用处理装置测定处于所述调控网络的对照状态中的每个相互作用的基因表达水平的二维概率密度;/n(c)使用所述处理装置测定处于所述调控网络的至少一个化合物扰动状态中的每个相互作用的基因表达水平的二维概率密度;/n(d)估算每个相互作用的对照概率密度与化合物扰动概率密度之间的差异;/n(e)仅基于基因表达数据,确定所估算的差异是否是统计上显著的,以提供一组统计学上显著的失调相互作用;/n(f)对所述统计学上显著的失调相互作用进行分级,以提供一组候选作用机制(MoA)基因;和/n(g)基于所述分级,确定所述组织特异性调控网络内的所述治疗化合物的MoA。/n
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