[发明专利]用于预测移植中的同种异体反应性的方法和系统

摘要

本发明涉及一种用于执行计算机实现的方法的方法、系统和/或数据结构，其中计算机实现的方法用于确定移植材料的一个或多个受体与一个或多个供体之间的预测的间接识别HLA表位(PIRCHES)的数量。在此所述的方法、系统和数据结构，通过经由计算机实现的方法来分析患者和供体的HLA衍生肽，使得能够识别可允许的错配，因而得到相对安全的移植材料。

主权项

一种计算机实现的方法，用于确定移植材料的一个或多个受体与一个或多个供体之间预测的间接识别HLA表位(PIRCHES)的数量，其中所述PIRCHES是来自错配的受体HLA等位基因的受体或供体特定的HLA衍生肽，并且被预测将由共享的(匹配的)HLA分子进行呈递，其中所述方法包括：a)从受体的错配HLA分子中识别肽；b)确定a)中所识别出的被预测将由一个或多个已选择的共享的(匹配的)HLA分子进行呈递的肽；c)从供体的所有已选择的HLA分子来识别肽；d)确定c)中所识别出的被预测将由一个或多个已选择的共享的(匹配的)HLA分子进行呈递的肽；其中e)对于每个共享的MHC I类HLA分子，在b)中所确定而不包括在d)的肽组中的任何肽被表征为PIRCHE I，或者对于每个共享的MHC II类HLA分子，在b)中所确定而不包括在d)的肽组中的任何肽被表征为PIRCHE II；其特征在于f)对于图形数据结构中所存储的信息来执行步骤a)到d)。