[发明专利]具有对压缩数据的快速操作的前缀Burrow-Wheeler变换在审
| 申请号： | 201580038227.8 | 申请日： | 2015-05-11 |
| 公开（公告）号： | CN108292307A | 公开（公告）日： | 2018-07-17 |
| 发明（设计）人： | 杰里米·布吕斯特勒 | 申请（专利权）人： | 螺旋遗传学公司 |
| 主分类号： | G06F17/30 | 分类号： | G06F17/30;G06F17/22;G06F17/27 |
| 代理公司： | 北京市磐华律师事务所 11336 | 代理人： | 谢栒;赵楠 |
| 地址： | 美国华*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 描述了前缀Burrows‑Wheeler变换(“PWBT”)以提供对数据集的数据操作，即使数据集被压缩。还描述了建立PWBT的技术——包括偏移表和前缀表——以及在数据集上应用由PWBT执行的数据操作的技术。数据操作包括k‑Mer子字符搜索。描述了使用PWBT例如剽窃搜索和开放源清理的技术的一般应用。还描述了PWBT的生物信息应用，例如基因组分析和基因组标记。 | ||
| 搜索关键词： | 数据操作 数据集 应用 基因组标记 基因组分析 压缩 快速操作 生物信息 字符搜索 开放源 偏移表 前缀表 剽窃 搜索 | ||
【主权项】：
1.一种包括软件组件以对一组原始词素的前缀表表示执行存在搜索数据操作的系统，包括：处理器；存储器，可通信地耦合到所述处理器；持久存储器，可通信地耦合到存储一组原始词素的前缀表表示的所述处理器；存在搜索软件组件，被存储在所述存储器中，配置成接收搜索模式并对在所述前缀表表示中的所述搜索模式执行词素搜索。
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