[发明专利]用于确定患者特定突变的致癌指数的方法和系统

摘要

提供了用于确定患者特定突变的多种致癌相关的指数的方法。提供的方法允许确定多种患者特定突变和对多种患者特定突变分级以及定性地和定量地确定多种相关的致癌指数。

主权项

1.携带包含患者特定突变的基因的第一组表达构建体及相应的野生型基因的第二组表达构建体在制备用于产生一种或更多种所述患者特定突变的致癌指数的试剂盒中的用途，当所述试剂盒被使用时，包括以下步骤：a.形成携带包含患者特定突变的基因的所述第一组表达构建体及相应的野生型基因的所述第二组表达构建体的可寻址阵列；b.对于所述可寻址阵列中的每个位点，添加编码荧光易位报告物(FTR)基因的表达载体，所述荧光易位报告物(FTR)基因包含连接至特定报告物基因部分的靶基因部分；c.将活的测定细胞在使得所述表达构建体和所述表达载体转染进入所述测定细胞的条件下添加至每个位点；d.比较表达包含所述突变的基因与表达其相应的野生型表达的基因的所述测定细胞中表达的FTR的亚细胞定位和/或易位，以鉴定不同结果；e.通过以下对候选的患者特定突变的所述不同结果进行定量：i)处理所述不同结果以确定所测试的FTR在所述第一组表达构建体和所述第二组表达构建体的存在下的易位程度，以确定所述患者特定突变的活化水平；ii)基于所述FTR在所述第二组表达构建体的存在下的易位程度归一化所述FTR在所述第一组表达载体的存在下的易位程度，以确定所述患者特定突变的归一化的活化水平；以及iii)分析所述患者特定突变的归一化的活化水平与临床结果(参考)之间的映射；以从而确定所述一种或更多种患者特定突变的所述致癌分级指数。