[发明专利]用于在三维解剖图像中自动分割个别骨骼骨的系统及方法

摘要

在某些实施例中，本文呈现的是用于在例如微CT成像的小动物成像的背景下进行稳健骨分裂及分割的方法。在某些实施例中，描述一种用于计算单个及混合二阶导数分裂滤波器并将其应用于灰度图像及二元骨掩模的方法。即使对于低分辨率数据，这些滤波器也可准确地识别所述骨的分裂线/平面，且因此准确地在形态学上断开个别骨。接着，可将分裂骨用作区生长技术中的种子，例如标记物控制的分水岭分割。使用此方法，与现有技术方法相比较，可以高得多的稳健性及准确性对骨进行分割。

主权项

一种执行图像分割以自动区分受试者的骨架或部分骨架的图像中的个别骨骼的方法，所述方法包括：由计算装置的处理器接收受试者(例如，小型哺乳动物受试者，例如小鼠)的图像(例如，二维图像或三维图像，例如，包括体素的三维图像，例如灰度图像)(例如，体内图像、离体图像或原位图像)(例如，通过体内成像系统，例如微CT成像仪获得)；由所述处理器将一或多个二阶导数分裂滤波器应用于所述图像以产生用于所述图像的分裂骨掩模；由所述处理器通过执行一或多个形态学处理操作(例如，通过执行连接组分分析及/或通过使用距离及分水岭变换来识别集水盆)来确定所述分裂骨掩模的多个分裂二元组分；任选地，由所述处理器量化每一分裂二元组分的体积并且消除具有不可接受的小体积的一或多个组分(例如，消除具有低于预定阈值的体积的一或多个组分)；以及由所述处理器使用所述分裂骨掩模组分作为种子执行区生长操作(例如，标记物控制的分水岭操作)，借此产生区分所述图像中的个别骨的分割图。