[发明专利]快速鉴定茎瘤芥杂交种纯度的方法有效

专利信息
申请号: 201610002597.2 申请日: 2016-01-06
公开(公告)号: CN105506113B 公开(公告)日: 2019-02-05
发明(设计)人: 沈进娟;刘雪姣;冉广葵;杨仕伟;于晓虎;冷容;范永红;曾胜;李娟 申请(专利权)人: 重庆市渝东南农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 重庆强大凯创专利代理事务所(普通合伙) 50217 代理人: 黄书凯
地址: 408000 *** 国省代码: 重庆;50
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摘要: 发明公开一种采用特异性引物快速鉴定茎瘤芥杂交种纯度的方法,从600对芸薹属十字花科SSR共同引物中筛选出在杂交种亲本多态性良好的引物,进一步对茎瘤芥杂交种涪杂1号‑8号及其亲本筛选,最终筛选出两条引物SSR Na14‑G06和SSR Ol11‑G11,对茎瘤芥的特异性强,该两条引物结合引物SSR Ol13‑E03能较好的分辨出“涪杂1号‑8号”杂交种与亲本条带以及杂交种中混有的油菜、白菜和儿菜等杂株,具体包括:应用改良CTAB快速法提取茎瘤芥杂交种DNA;用筛选出的引物对杂交种DNA模板进行PCR扩增;对扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,准确率高,大大缩短了茎瘤芥杂交种纯度的鉴定周期,具有较强的实用性。
搜索关键词: 杂交种 茎瘤芥 引物 杂交种纯度 快速鉴定 筛选 亲本 聚丙烯酰胺凝胶电泳 特异性引物 鉴定周期 结合引物 扩增产物 亲本筛选 十字花科 特异性强 多态性 快速法 准确率 儿菜 条带 白菜 分辨 油菜 改良 检测 应用
【主权项】:
1.快速鉴定茎瘤芥杂交种纯度的方法,包括DNA提取、PCR扩增步骤,其特征在于:所述的PCR扩增步骤中的PCR反应体系中包含以下序列的引物:SSR Ol11‑G11正义链序列:GTTGCGGCGAAACAGAGAAG;反义链序列:GAGTAGGCGATCAAACCGAG;另外,还包括以下序列的引物:SSR Na14‑G06正义链序列:AAACGGCTTGCATTGTTCTC;反义链序列:GGCTTGCTTGATCCAGTCTC;SSR Ol13‑E03正义链序列:CTCTGTTTCCTCTGCCCAAC;反义链序列:AGGGAAGGAAAGGACACGAC中的任意一种;所述的SSR Na14‑G06正义链序列的TM值为58℃、反义链序列的TM值为62℃,SSR Ol11‑G11、SSR Ol13‑E03的正义链序列和反义链序列的TM值均为62℃;所述的PCR反应体系中的还包括以下各组分:15μL:1×缓冲液,2.5μmol/L MgCl2、150μmol/L dNTP、1U DNA聚合酶和100ng DNA模板,每个引物含量为0.2μmol/L;所述的PCR扩增的方法为:95℃预变性5min,1个循环;95℃预变性40s,62℃退火30s,72℃延伸1min,每个循环降1℃,共11个循环;95℃预变性40s,52℃退火40s,72℃延伸1min,共30个循环,72℃再延伸5min;4℃低温保存。
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