[发明专利]猪9号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点

摘要

本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪9号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr9:8179045；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr9‑PCRU：5’‑TAT AAA AGA CTG TGT TGC TGC TAG A‑3’；Chr9‑PCRL：5’‑AAT GTC AAA CTA GTT TAA GGA GTT GAA‑3’；Chr9‑SNPU：5’‑TGA CTT TAG TGG GTG GCT GAG AAC TTA CAT‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于C/C基因型,T为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr9:8179045这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

主权项

1.一种检测猪9号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点的引物在检测猪产仔数中的应用，其特征在于：所述引物包括PCR扩增引物以及延伸引物，其中PCR扩增引物的核苷酸序列如下所示：Chr9‑PCRU：5’‑TATAAAAGACTGTGTTGCTGCTAGA‑3’；Chr9‑PCRL：5’‑AATGTCAAACTAGTTTAAGGAGTTGAA‑3；延伸引物的核苷酸序列如下所示：Chr9‑SNPU5‑TGACTTTAGTGGGTGGCTGAGAACTTACAT‑3’，所述猪为白色杜洛克×二花脸猪杂交资源群F2代母猪，所述SNP位点为基因组版本NCBI Sscrofal10.2的Chr9:8179045,该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，带有T/C基因型的猪产仔数高于带有C/C和T/T基因型的猪，其中基因型C/T为提高猪产仔数的有益基因型。