[发明专利]一种基于大规模数据挖掘的癌症检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201610018232.9 | 申请日: | 2016-01-12 |
公开(公告)号: | CN105653898A | 公开(公告)日: | 2016-06-08 |
发明(设计)人: | 钱自亮;郑媛虹;魏国鹏 | 申请(专利权)人: | 江苏格致生命科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;G06F19/24 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 汪旭东 |
地址: | 212132 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开一种基于大规模数据挖掘的癌症检测试剂盒及检测方法,属于生物医学检测技术领域;本发明所述试剂盒包括DNA提取试剂、高通量测序文库制备试剂、基因序列比对软件和染色体覆盖度计算软件;本发明首先从受试者采集外周血并分离血浆;用DNA聚合酶扩增并制备测序文库;对所制备的文库进行大规摸测序;测序结果通过序列比对,统计其在基因组上的分布情况,判断是否有来源于肿瘤组织的癌细胞基因组序列,从而判断检测对象是否携带癌症;本发明克服了现有肿瘤筛查技术特异性和敏感度的不足;该方法无辐射、无创伤,只需要4-10mL外周血就可以实现对癌症的检测。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 大规模 数据 挖掘 癌症 检测 试剂盒 方法 | ||
【主权项】:
一种基于大规模数据挖掘的癌症检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:DNA提取试剂、高通量测序文库制备试剂、基因序列比对软件、染色体覆盖度计算软件;其中所述DNA提取试剂用于提取外周血游离DNA,通过所述高通量测序文库制备试剂制备高通量测序文库,通过对测序文库高通量测序,利用所述基因序列比对软件将测序数据与人类参考基因组作比较,通过染色体覆盖度计算软件进行数据分析以区分癌症和非癌症病人,进一步分析判断肿瘤类型和可能原发灶器官。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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