[发明专利]用以分析细菌菌种的测序数据的系统及其方法

摘要

本发明涉及一种用以分析细菌菌种的测序数据的系统及其方法。用以分析细菌菌种的测序数据的方法包含搜索第一基因样本序列中的特定变异区域以及搜索第二基因样本序列中的另一特定变异区域；判断特定变异区域与另一特定变异区域是否存在相同的一跨检体子序列；当特定变异区域与另一特定变异区域存在相同的跨检体子序列时，储存跨检体子序列至记录表中；当存在跨检体子序列时，将跨检体子序列与一数据库模块中的多个已知菌种基因序列进行比对，以分析该第一基因样本序列与第二基因样本序列中对应跨检体子序列的菌种。由此减少测序数据的系统的运算量，以达到提升分析检体数据速度的功效。

主权项

一种用以分析细菌菌种的测序数据的系统，其特征在于包含：单一检体去重复序列模块，用以搜索第一基因样本序列中的第一保守区域及一特定变异区域，并将该第一保守区域移除；跨检体重复序列判断模块，用以判断该特定变异区域是否存在与第二基因序列中的另一特定变异区域相同的一跨检体子序列；重复序列记录模块，当该特定变异区域存在与该第二菌体样本中的该另一特定变异区域相同的该跨检体子序列时，该重复序列记录模块用以储存该跨检体子序列至一记录表中；运算贴序模块，当存在该跨检体子序列时，该运算贴序模块用以将该跨检体子序列与数据库模块中的多个已知菌种基因序列进行比对，以分析该第一基因样本序列与该第二基因样本序列中对应该跨检体子序列的菌种。