[发明专利]55个SNP位点多色荧光复合检测的方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201610109822.2 申请日: 2016-02-26
公开(公告)号: CN105695575A 公开(公告)日: 2016-06-22
发明(设计)人: 丛斌;李淑瑾;王茜 申请(专利权)人: 河北医科大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 石家庄国为知识产权事务所 13120 代理人: 李瑞妍
地址: 050017 河北省石家庄*** 国省代码: 河北;13
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摘要: 发明公开了一种55个SNP位点多色荧光复合检测的方法及试剂盒,涉及包括核酸的测定或检验方法技术领域。试剂盒包括PCR引物,DNA聚合酶,PCR缓冲液,核酸外切酶Ⅰ,虾碱性磷酸酶,延伸引物,SNaPshot反应混合液,Hi-Di甲酰胺和GeneScanTM Size Standards-120 LIZ;PCR引物和延伸引物由55个SNP基因位点的引物组成,分别针对包含55个SNP位点的DNA片段。采用本发明可以快速、准确地获得55个SNP位点的基因分型,并通过荧光自动分型设备检测分析,对人类生物检材进行个体识别,具有很大优势和潜力,具有很高的系统效能。
搜索关键词: 55 snp 多色 荧光 复合 检测 方法 试剂盒
【主权项】:
55个SNP位点多色荧光复合检测的试剂盒,其包括a)扩增体系:PCR缓冲溶液、MgCl2、dNTPs、PCR引物、Taq DNA聚合酶、模板DNA,b)扩增产物纯化试剂:核酸外切酶Ⅰ、虾碱性磷酸酶,c)延伸反应试剂:延伸引物、SNaPshot反应混合液,d)延伸产物纯化试剂:虾碱性磷酸酶,e)测试试剂:Hi‑Di甲酰胺和GeneScanTM Size Standards‑120 LIZ,其特征在于,所述PCR引物和延伸引物由55个SNP基因位点的引物组成,所述55个SNP基因位点在NCBI中SNP数据库的rs号分别为rs1109037,rs3780962,rs6591147,rs2342747,rs9951171,rs13182883,rs10092491,rs6955448,rs6444724,rs430046,rs321198,rs159606,rs560681,rs214955,rs13218440,rs9905977,rs1821380,rs279844,rs8078417,rs4606077,rs445251,rs987640,rs4530059,rs338882,rs10488710,rs6811238,rs722290,rs7041158,rs7520386,rs9866013,rs1498553,rs2270529,rs1478829,rs1523537,rs4364205,rs985492,rs12997453,rs740598,rs1736442,rs1294331,rs993934,rs10776839,rs315791,rs576261,rs2399332,rs2272998,rs7205345,rs2269355,rs1058083,rs10773760,rs464663,rs221956,rs1336071,rs1027895和位于人类牙釉质蛋白基因Amelogenin gene上的一个性别检测SNP位点,所述性别检测SNP位点在女性个体中为纯合子T/T,在男性个体中为杂合子C/T,性别检测SNP位点的5’侧翼序列为TTTTACCTTCTTCTTTCT,3’侧翼序列为TTGTAGAACTCACATTCTCAGGC。
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