[发明专利]一种用于鉴定转基因甘蔗红糖的引物组合物、试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201610134944.7 | 申请日: | 2016-03-10 |
公开(公告)号: | CN105586428B | 公开(公告)日: | 2018-06-29 |
发明(设计)人: | 王文治;杨本鹏;张树珍;蔡文伟;熊国如;冯翠莲;王俊刚;赵婷婷;武媛丽;沈林波;冯小艳 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳市千纳专利代理有限公司 44218 | 代理人: | 李平 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | 本发明涉及一种鉴定转基因甘蔗红糖的引物组合物、试剂盒及检测方法,其引物组合物包括第一引物组和第二引物组,所述第一引物组为扩增甘蔗内源基因ShSAP1的引物对,所述第二引物组选自扩增甘蔗外源基因35S的引物对、扩增甘蔗外源基因tNOS的引物对、扩增甘蔗外源基因CP4‑EPSPS的引物对、扩增甘蔗外源基因Cry1Ab的引物对、扩增甘蔗外源基因Vip3Aa的引物对、扩增甘蔗外源基因Bar的引物对中的一种或多种。本发明的鉴定方法操作简单,成本低,能稳定的从甘蔗红糖中提取高质量的模板DNA用于荧光定量PCR检测,且准确性和灵敏度高。 | ||
搜索关键词: | 甘蔗 扩增 引物 外源基因 红糖 引物组合物 转基因甘蔗 第二引物 第一引物 试剂盒 荧光定量PCR检测 内源基因 模板DNA 灵敏度 种鉴定 检测 | ||
【主权项】:
1.一种用于鉴定转基因甘蔗红糖的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1,从样品中提取DNA,每5g红糖按如下方式提取:称取红糖5g,置于50ml的离心管中,加入20ml的CTAB裂解液,65℃温浴溶解1小时,期间进行两到三次的漩涡震荡处理;冷却 后,加入20ml氯仿/异戊醇(24:1),摇晃震荡均匀后,12000rpm离心10min,用5ml的移液枪头深入离心管底部,吸弃底层液相,再加入20ml氯仿/异戊醇(24:1)进行抽提,如此反复2‑3次;最后吸取上层水相至另一干净的离心管内,加入等体积预冷的异丙醇,‑20℃沉淀30‑60min,12000rpm离心10min,倒掉上清后,沉淀加20ml水再次溶解,加1/10体积的NaAc,再次加入等体积预冷的异丙醇,‑20℃沉淀30‑60min,沉淀再次用900ul的水进行溶解,并转移至2ml的离心管内,加1/10体积的NaAc及等体积预冷的异丙醇,‑20℃沉淀30‑60min,沉淀吹干后溶解于50‑100ul的水或TE中;步骤2,用引物组合物进行荧光定量PCR扩增,得到扩增产物;其中,所述引物组合物包括第一引物组和第二引物组,所述第一引物组为扩增甘蔗内源基因ShSAP1的引物对,所述第二引物组由扩增甘蔗外源基因35S的引物对、扩增甘蔗外源基因tNOS的引物对、扩增甘蔗外源基因CP4‑EPSPS的引物对、扩增甘蔗外源基因Cry1Ab的引物对、扩增甘蔗外源基因Vip3Aa的引物对和扩增甘蔗外源基因Bar的引物对组成,其中,扩增甘蔗内源基因ShSAP1的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:1所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:2所示;扩增甘蔗外源基因35S的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:4所示;扩增甘蔗外源基因tNOS的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:5所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:6所示;扩增甘蔗外源基因CP4‑EPSPS的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:7所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:8所示;扩增甘蔗外源基因Cry1Ab的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:9所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:10所示;扩增甘蔗外源基因Vip3Aa的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:11所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:12所示;扩增甘蔗外源基因Bar的引物对的正向引物的序列如SEQ ID NO:13所示,反向引物的序列如SEQ ID NO:14所示;步骤3,检测扩增产物,并作出判断。
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