[发明专利]一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201610149819.3 申请日: 2016-03-16
公开(公告)号: CN105671175B 公开(公告)日: 2019-04-05
发明(设计)人: 蓝贤勇;金云云;陈宏;雷初朝;祁兴磊;林凤鹏;祁兴山;屈卫东 申请(专利权)人: 西北农林科技大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 陆万寿
地址: 712100 陕*** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明公开了一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法及其应用。以包含SPAG17基因的待测全基因组DNA为模板,以参照牛全基因组设计的引物对P1为引物,通过PCR技术扩增SPAG17基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定SPAG17基因在AC_000160:g146755‑146756insTCCTGACT位点存在不同的基因型。结果发现,SPAG17基因8‑bp插入/缺失的不同类型与夏南牛体高和体斜长等生长发育性状之间存在显著相关,提示SPAG17基因8‑bp插入/缺失的不同类型可作为提高夏南牛生长发育性状的DNA标记。故本发明将有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
搜索关键词: 一种 黄牛 spag17 基因 插入 缺失 检测 方法 及其 应用
【主权项】:
1.一种黄牛SPAG17基因插入/缺失的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:以待测夏南牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,通过PCR扩增夏南牛SPAG17基因片段,该片段包含夏南牛SPAG17基因8‑bp插入/缺失多态性位点;再对PCR扩增得到的片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定夏南牛SPAG17基因在AC_000160:g146755‑146756的8‑bp插入/缺失多态性位点的插入/缺失多态性;所述的引物对P1为:上游引物:5’‑ACATGGGAGAAATACCCG‑3’;下游引物:5’‑GTCTGAAGATGGCAAACG‑3’;所述插入/缺失多态性为:插入/插入基因型表现为255bp一条带纹;插入/缺失基因型表现为247bp和255bp两条带纹;缺失/缺失基因型表现为247bp一条带纹。
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