[发明专利]一种预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法

摘要

本发明涉及一种预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法，用于获取RNA病毒基因序列被选为蛋白质结合位点的概率，该方法包括以下步骤：1)获取多条RNA病毒基因序列；2)以设定的单位长度对每条所述RNA病毒基因序列进行位点信息量计算并比较，获得最大位点信息量及该最大位点信息量所对应的位点信息，根据所述位点信息获得结合位点。与现有技术相比，本发明能够迅速地、准确地预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法，为探究RNA病毒的复制机制提供帮助。

主权项

一种预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法，用于获取RNA病毒基因序列被选为蛋白质结合位点的概率，其特征在于，该方法包括以下步骤：1)获取多条RNA病毒基因序列；2)以设定的单位长度对每条所述RNA病毒基因序列进行位点信息量计算并比较，获得最大位点信息量及该最大位点信息量所对应的位点信息，根据所述位点信息获得结合位点，其中，所述位点信息量的计算公式为：$H_l=-\underset{b_l=A,C,G,T}{\Σ}p\left(b_l\right)ln\[p\left(b_l\right)/p^0\left(b_l\right)\]$$H_{seq}=\underset{l=1}{\overset{S}{\Σ}}{H}_l$式中，H_l是位点中每个位置的信息量，H_seq是位点信息量，bl表示碱基，有A、C、G、T四种碱基，p(bl)是各位置中碱基出现的概率，p⁰(bl)是基因组中碱基出现的概率，S是位点中位置的个数。