[发明专利]一种lncRNA RP11-697E22.2能够作为逆转卵巢癌干预靶标使用的方法在审
申请号: | 201610287935.1 | 申请日: | 2016-05-04 |
公开(公告)号: | CN105907858A | 公开(公告)日: | 2016-08-31 |
发明(设计)人: | 李青 | 申请(专利权)人: | 李青 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海国智知识产权代理事务所(普通合伙) 31274 | 代理人: | 潘建玲 |
地址: | 201200 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于生物工程技术领域,提供了lncRNA RP11‑697E22.2能够作为逆转卵巢癌干预靶标使用的方法,包括:采用lncRNA芯片技术对卵巢癌组织中化疗耐药lncRNA筛选;对样本上的靶基因进行GO和Pathway分析;得出靶基因的功能与肿瘤增殖、凋亡、存活相关,涉及肿瘤耐药相关的信号通路;对编码蛋白的lncRNA进行筛选;选择差异倍数较大的3条lncRNA;对lncRNA表达情况进行观察,得出RP11‑697E22.2在所有卵巢癌细胞细胞株中表达均显著升高,进而得出lncRNA RP11‑697E22.2参与了不同类型卵巢癌耐药的调控,能够作为卵巢癌防治的干预靶标。 | ||
搜索关键词: | 一种 lncrna rp11 697 e22 能够 作为 逆转 卵巢癌 干预 靶标 使用 方法 | ||
【主权项】:
一种lncRNA RP11‑697E22.2能够作为逆转卵巢癌干预靶标使用的方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一,采用lncRNA芯片技术,开展对卵巢癌组织中化疗耐药相关lncRNA的筛选,挑选出两类获得性耐药样本;步骤二,对步骤一中挑选出的两类获得性耐药样本上的靶基因进行GO分析和Pathway分析;步骤三,分析得出步骤二中靶基因的功能与肿瘤增殖、凋亡、存活密切相关,并涉及PI3K/AKT/mTOR、MAPK、Nrf2多条肿瘤耐药相关的信号通路;说明了lncRNA芯片筛选分析结果符合肿瘤的生物学特征;步骤四,对编码蛋白的lncRNA进行筛选,得出比较有代表性的8条lncRNA,分别为ENST00000435726、uc010jub.1、ENST00000584612、RP11‑697E22.2、ENST00000566734、TCONS_00008505、ENST00000453783和NR_023915;步骤五,8条lncRNA在Realtime PCR实验中的结果与lncRNA芯片筛选分析结果相一致,说明8条lncRNA芯片的实验重复性较好;步骤六,选择差异倍数较大的3条lncRNA,分别为RP11‑697E22.2、ENST00000435726和uc010jub.1;步骤七,选取多种化疗药物耐药的卵巢癌细胞株,设置亲本细胞株作为对照试验,检测步骤六中3条lncRNA的表达情况;步骤八,对步骤七中的3条lncRNA表达情况进行持续观察,得出lncRNA RP11‑697E22.2在所有化疗药物耐药的卵巢癌细胞细胞株中表达均显著升高,进而得出lncRNA RP11‑697E22.2参与了不同类型卵巢癌耐药的调控,能够作为卵巢癌防治的干预靶标。
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