[发明专利]一种完整糖肽鉴定的方法与系统有效
| 申请号： | 201610309699.9 | 申请日： | 2016-05-11 |
| 公开（公告）号： | CN106018535B | 公开（公告）日： | 2018-11-09 |
| 发明（设计）人： | 曾文锋;刘铭琪;张晓今;吴建强;张扬;孙瑞祥;杨芃原;贺思敏 | 申请（专利权）人： | 中国科学院计算技术研究所 |
| 主分类号： | G01N27/62 | 分类号： | G01N27/62 |
| 代理公司： | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人： | 王勇;叶北琨 |
| 地址： | 100190 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供一种完整糖肽鉴定的方法，包括：对于任一待鉴定的实测串联质谱，遍历糖链结构数据库，对于其中每个糖链结构：根据当前串联谱图的母离子质量，推断出碎裂测试中所有可能获得的糖肽Y离子的质量，进而计算匹配到当前二级谱图的谱峰的数目，并将这个匹配谱峰的数目作为对应情形下的糖肽Y离子与当前二级谱图匹配的粗打分结果；取粗打分前K名的糖链结构作为候选糖链结构；对于当前串联谱图，遍历所有的候选糖链结构，对于每一候选糖链结构进行实测谱和肽段的理论谱的谱谱匹配打分，以及实测谱和糖链结构的理论谱的谱谱匹配打分，进而得出糖肽结构鉴定结果。本发明能够提高完整糖肽规模化鉴定的可靠性且计算复杂度低。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 完整 糖肽 鉴定 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种完整糖肽鉴定的方法，包括下列步骤：1)获取同时含有糖链碎片信息和肽段碎片信息的糖肽二级碎裂的实测串联质谱；2)对于任一待鉴定的实测串联质谱，遍历糖链结构数据库，对于其中每个糖链结构，执行步骤21)～22)，直至糖链结构数据库中所有糖链结构遍历完毕；21)对于当前糖链结构，根据当前串联谱图的母离子质量，推断出碎裂测试中所有可能获得的糖肽Y离子的质量；22)根据步骤21)所得出的每一种情形下的糖肽Y离子的质量，计算匹配到当前二级谱图的谱峰的数目，并将这个匹配谱峰的数目作为对应情形下的糖肽Y离子与当前二级谱图匹配的粗打分结果；3)取粗打分结果在前K名的糖链结构作为当前串联谱图的候选糖链结构；其中，K为预设的糖链结构的候选数目；4)对于当前串联谱图，遍历所有的候选糖链结构，对于每一候选糖链结构，进行实测谱和肽段的理论谱的谱谱匹配打分，以及实测谱和糖链结构的理论谱的谱谱匹配打分，进而得出糖肽结构鉴定结果。
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