[发明专利]一种单细胞外显子测序肿瘤体细胞突变检测方法

摘要

本发明提供了一种单细胞外显子测序肿瘤体细胞突变检测方法，包括如下步骤，(1)计算单细胞基因组突变的假阳性率；(2)计算在单细胞样本测序中的等位基因丢失率；(3)挖掘体细胞突变，过滤体细胞突变；(4)分析单细胞间的异质性。本发明通过对单细胞突变位点假阳性率、等位基因丢失率的计算，过滤肿瘤中的体细胞突变，并分析单细胞之间的异质性，本发明根据单细胞基因组突变的假阳性情况论证测序结果的可靠性，能够检测单细胞实验技术的可靠性，能够对后续结果进行多功能分析。

主权项

1.一种单细胞外显子测序肿瘤体细胞突变检测平台，其特征在于：所述检测平台用于筛选体细胞突变，检测平台具有如下特点：(1)计算单细胞基因组突变的假阳性率；通过组织测序和单细胞测序获得在组织样本和单细胞样本中的突变位点信息，首先定义在组织测序和单细胞测序中都发现的突变为真阳性突变(TP mutation)，在组织测序中发现但是在单细胞中没有发现的突变是假阴性突变(FN mutation)，在单细胞中发现但是没有在组织测序中发现的突变是假阳性突变(FP mutation)，在组织测序中没有被识别成突变的位点为真阴性突变(TN mutation)，根据上述数据计算假阳性率FPR＝FP/(FP+TN)，假阳性率越高，突变位点的可靠性越低；(2)计算在单细胞样本测序中的等位基因丢失率；首先定义在组织数据中突变频率小于95％的位点是杂合性突变，若杂合性突变位点的突变频率大于或等于95％则为纯合性突变，提取杂合性突变位点，并找其对应的单细胞中是否变为纯合性突变，并计算在单细胞中变为纯合性突变的比例，该比例即为等位基因丢失率，等位基因丢失率越高，突变位点的可靠性越低；(3)挖掘体细胞突变，过滤体细胞突变；(4)分析单细胞间的异质性。