[发明专利]DNA序列的处理方法及设备有效
| 申请号： | 201610330331.0 | 申请日： | 2016-05-18 |
| 公开（公告）号： | CN107403076B | 公开（公告）日： | 2020-06-02 |
| 发明（设计）人： | 邓利群;魏建生;张军 | 申请（专利权）人： | 华为技术有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 北京同达信恒知识产权代理有限公司 11291 | 代理人： | 冯艳莲 |
| 地址： | 518129 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 一种DNA序列的处理方法及设备，用以解决现有技术对DNA样本进行变异检测的效率低下的问题。包括：对每个Read集合分别并行执行以下操作：根据染色体的参考序列对Read集合中的每个Read进行比对计算，得到每个Read相对该参考序列的比对结果记录；根据该比对结果记录确定每个Read所处的染色体区域；将处于同一染色体区域的Read的比对结果记录合并成一个中间结果文件；在对N个Read集合分别执行完上述操作后，每个染色体区域分别对应N个中间结果文件；根据每个染色体区域分别对应的N个中间结果文件，确定每个染色体区域的目标序列文件；根据每个该染色体区域的目标序列文件确定每个染色体区域的变异点信息。 | ||
| 搜索关键词： | dna 序列 处理 方法 设备 | ||
【主权项】：
一种DNA序列的处理方法，其特征在于，所述方法用于对脱氧核糖核酸DNA样本的N个Read集合进行处理，其中，每个所述Read集合中包括由对应的测序文库对所述DNA样本测序得到的序列片段Read，N为大于1的正整数，所述方法包括：对每个所述Read集合分别并行执行以下操作：根据染色体的参考序列对Read集合中的每个Read进行比对计算，得到每个所述Read相对所述参考序列的比对结果记录；根据所述比对结果记录确定每个所述Read所处的染色体区域；所述染色体包括至少一个所述染色体区域；将处于同一染色体区域的所述Read的比对结果记录合并成一个中间结果文件；其中，用于与每个所述Read集合进行比对计算的染色体的参考序列相同，且所述染色体包括的染色体区域相同，在对每个所述Read集合执行完上述操作后，每个所述染色体区域分别对应N个所述中间结果文件；根据每个所述染色体区域分别对应的N个所述中间结果文件，确定每个所述染色体区域的目标序列文件；对每个所述染色体区域的目标序列文件进行变异检测，确定每个所述染色体区域的变异点信息。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于华为技术有限公司，未经华为技术有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201610330331.0/，转载请声明来源钻瓜专利网。
