[发明专利]对T细胞表位进行优化的方法及由此制备的肽文库的组合物有效
| 申请号： | 201610333274.1 | 申请日： | 2016-05-19 |
| 公开（公告）号： | CN106021974B | 公开（公告）日： | 2019-05-03 |
| 发明（设计）人： | 刘玉凡;王政清 | 申请（专利权）人： | 中牧智合（北京）生物技术有限公司 |
| 主分类号： | G16B5/00 | 分类号： | G16B5/00;G16B20/00;C40B40/10 |
| 代理公司： | 北京永新同创知识产权代理有限公司 11376 | 代理人： | 栾星明;程大军 |
| 地址： | 100095 北京市海淀区北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明通过生物大数据探勘的方法进行T细胞表位筛选、MHCII分子三维模型建构、T细胞表位优化设计，合理的设计基于表位的疫苗的肽组合文库，在维持免疫结构抗原表位的同时，模拟跨族群的T细胞表位个体变异特性，以覆盖由于地域或种类差异及高度可变性免疫组织相容复合物的广泛范围，从而得到具有对口蹄疫病毒更有效的T细胞表位，并提供广泛保护力的肽疫苗。实验结果也表明，T细胞表位优化具有相当的可行性，并预期可针对不同物种的不同病毒的各种疫苗进行优化设计。 | ||
| 搜索关键词： | 细胞 进行 优化 方法 由此 制备 文库 组合 | ||
【主权项】：
1.一种对T细胞表位进行优化的方法，包括以下步骤：1)选择目标物种的适合的T细胞表位；2)对目标物种的MHC‑DR进行同源建模；以及3)对所述T细胞表位进行优化，其包括以下一或多个步骤：a.比较目标物种MHC‑DR的MHC‑肽复合体的口袋容积，确定MHC口袋分布；b.T细胞表位优化，包括以下步骤：i.在所述T细胞表位结合核心的主要结合位置额外引入尺寸不同的氨基酸残基的复合取代以匹配不同的口袋；ii.在所述T细胞表位结合核心的次要结合位置额外引入附加残基的复合取代以增加结合度；或者iii.延伸肽疫苗上T细胞表位结合核心两端的肽长度以增加结合度。
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