[发明专利]一种构建高效MPI设备层扩展库的方法有效
申请号: | 201610339916.9 | 申请日: | 2016-05-22 |
公开(公告)号: | CN106055415B | 公开(公告)日: | 2019-07-23 |
发明(设计)人: | 雷咏梅;方铃 | 申请(专利权)人: | 上海大学 |
主分类号: | G06F9/54 | 分类号: | G06F9/54;H04L29/06;H04L29/08 |
代理公司: | 上海上大专利事务所(普通合伙) 31205 | 代理人: | 何文欣 |
地址: | 200444*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明涉及一种构建高效MPI设备层扩展库的方法。本方法是利用MPICH3的PMI KVS空间的功能,结合PCI Express互联结构的特点,提出控制和数据双通道的通信模式,通过以太网仅传输必需的控制信息,使用高速的PCI Express来传输数据信息,通过进程PMI put操作保存本地计算节点端口等信息到本地KVS中,同时同步到远程服务端KVS,而其他进程再通过PMI get操作获取各进程所在计算节点端口等信息,从而建立节点间通信关系,实现这种嵌入式混合异构系统运算节点之间高效的数据传输,实现MPI并行程序无缝移植和高效运行。 | ||
搜索关键词: | 一种 构建 高效 mpi 设备 扩展 方法 | ||
【主权项】:
1.一种构建高效MPI设备层扩展库的方法,其特征在于操作步骤如下:A.虚连接的初始化;B.控制和数据传输双通道模式的设计;C.系统基本功能设计与实现;所述步骤B中控制和数据传输双通道模式的设计如下:与进程管理相关的信息通过TCP进行传输,而数据信息发送、接收通过PCIExpress总线传输,具体的过程如下:1)将端口号信息和设定的key,字符串“endpoint”,通过PMI_KVS_Put方法写入本地KVS中;2)从整个树形结构中层层提交到远程的Launch node端KVS中;3)其他进程按照这个key值在对应的进程KVS中去查找需要的端口号信息;因为每一块板卡有一个唯一的IP地址,也对应一个唯一的端口,本地初始化时可以通过kernel提供的方法获得端口号,然后通过上面的方法去进行保存;4)在每个进程虚连接初始化的时候去通过PMI_KVS_Get方法查询每个进程rank值对应的端口号信息,并保存到虚连接中;所述步骤C中系统基本功能设计与实现数据包的设计和数据的发送和接收:当发送方向接收方发送数据时:a).先为本次通信过程分配唯一的序列号,再填充源端口号和目的端口号,源进程号和目的进程号以及数据长度信息,将控制信息数据包发送给PC端;b).PC端接收到控制信息数据包,得到目的端口号和序列号信息,并等待发送方发送数据;c).发送方将数据发送给PC端;d).当PC端接收到所有数据时,将数据发送到目的端口号;由于一块板卡上运行多个应用进程,而每一个进程会从同一个端口读取数据,从而使得数据读取混乱,所以采用为板卡上每一个进程预设内存缓冲池的去存放PC端发送来的数据,当设备层扩展库读取数据时,按进程号读取对应缓冲池上的数据,再拷贝到用户数据区。
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