[发明专利]水稻早抽穗主效QTL分子标记及其鉴定方法和应用

摘要

本发明公开一种水稻早抽穗主效QTL分子标记及其鉴定方法和应用，发现了水稻早抽穗主效QTL qHD8.3分子标记，分别是RM6670、M55、M07、M13和M15，利用上述分子标记对应的引物中的一对或多对进行PCR扩增，对扩增产物进行检测；本发明还提供了上述分子标记或分子标记鉴定方法在水稻早抽穗QTL qHD8.3的定位与克隆中的应用。通过本发明可加快该早抽穗QTL qHD8.3的克隆，并可将其应用于辅助选择育种，便于及时的杂交转育，加快育种进程。

主权项

1.一种水稻早抽穗主效QTL分子标记的获取方法，其特征在于包括以下步骤：以DP30为供体亲本，以籼稻品种9311为受体亲本和轮回亲本，通过连续回交、自交并定向选择，在BC₄F₂代获得稳定遗传的早抽穗染色体片段代换系CSSL13；再将代换系CSSL13与9311杂交，获得F₁杂交种，自交后获得F₂分离群体，选择F₂群体中抽穗期表现为早期或晚期的多个单株，分别种植成F_2:3株系，选择F_2:3株系没有分离的对应F₂单株用于连锁分析，获得以下水稻早抽穗主效QTL分子标记：分别是RM6670、M55、M07、M13和M15，其对应的引物分别是：RM6670：上游引物：5'—TCCGTCGCTGCAAATTAGTCC— 3'；下游引物：5'—CCATGTACCTCTATAATGGCAAGACC— 3'；M55：上游引物：5'—CCATTTGGTAGGTCCATCTTACCC— 3'；下游引物：5'—CTCCCAAGTGAAGTGCTGTCTGG— 3'；M07：上游引物：5'—GGTGGTCTTGATTCCCTTGT— 3'；下游引物：5'—GAAACAGATCAGCCTCACTG— 3'；M13：上游引物：5'—ATATACAAGCGAACTCCTGT— 3'；下游引物：5'—TAAGTGCGATGAAACAATGA— 3'；M15：上游引物：5'—TGGCACCATCCTCATTGCTC— 3'；下游引物：5'—AGCGTCGTCAGATACATTGG— 3'。