[发明专利]禾本科七个主要牧草属DNA条形码通用序列的筛选方法在审
申请号: | 201610364938.0 | 申请日: | 2016-05-26 |
公开(公告)号: | CN106047999A | 公开(公告)日: | 2016-10-26 |
发明(设计)人: | 焦婷;赵生国;吴建平;李永青;梁建勇;文禹粱;安雪姣 | 申请(专利权)人: | 甘肃农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 董芙蓉 |
地址: | 730070 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | 一种禾本科七个主要牧草属DNA条形码通用序列的筛选方法,包括以下步骤:(1)首先根据GenBank中禾本科牧草matk和rbcl基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立针对禾本科七个主要牧草属八种牧草11个样品的目的片段的扩增条件进行扩增;(2)然后对扩增产物进行测序和分析,经分别比对,筛选出七个主要牧草属的四个标记位点5’端和3’端保守序列,对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性的单倍型分析,可知matk1、matk2、matk3分别有6个单倍型、7个单倍型和3个单倍型,rbcl基因有5个单倍型;(3)然后根据matk和rbcl基因筛选的四个标记位点,建立八种牧草相对应的特异DNA识别码。本发明引物通用性好,扩增效果很理想,同时物种识别率高。 | ||
搜索关键词: | 禾本科 七个 主要 牧草 dna 条形码 通用 序列 筛选 方法 | ||
【主权项】:
一种禾本科七个主要牧草属DNA条形码通用序列的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)首先根据GenBank中禾本科牧草matk和rbcl基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立针对禾本科七个主要牧草属八种牧草11个样品的目的片段的PCR扩增条件进行扩增;(2)然后对扩增产物进行测序和分析,经分别比对,筛选出七个主要牧草属的四个标记位点5’端和3’端保守序列,对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性的单倍型分析,可知matk1、matk2、matk3分别有6个单倍型、7个单倍型和3个单倍型,rbcl基因有5个单倍型;(3)然后根据matk和rbcl基因筛选的四个标记位点,建立八种牧草相对应的特异DNA识别码。
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