[发明专利]一种将基因信息进行可视化图像表示的方法有效

专利信息
申请号: 201610382945.3 申请日: 2016-06-02
公开(公告)号: CN106096333B 公开(公告)日: 2019-07-16
发明(设计)人: 谢清禄;徐宏锴;朱军;余孟春 申请(专利权)人: 广州麦仑信息科技有限公司
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B45/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 510665 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种基因信息的可视化图像表示方法,在基因信息的二进制存储的基础上,通过字节流图像表示的方式对基因信息进行可视化转换,转换成可视的图像信息表示。该方法利用二进制转换的方法,把基因信息转化为一个二进制字节流,根据不同的颜色空间,将字节流数据转换形成二维的图像数据,可选的色彩空间包括:RGB、HSV、GRAY单通道;二维图像矩阵的结构可采取固定列,或固定行,或正方形拟合三种方式;在运用程序进行转换时,每个碱基组得到一个固定的8位二进制数,然后8位二进制数再乘以4作为H(色度)值,128作为S(饱和度)值,128作为V(亮度)值,生成HSV颜色模型,然后再转换成RGB颜色模型,最后生成JPG格式的可视化图像。
搜索关键词: 一种 基因 信息 进行 可视化 图像 表示 方法
【主权项】:
1.一种基因信息的可视化图像表示方法,其特征在于,所述的方法包括:利用二进制转换的方法,把基因信息转化为一个二进制字节流,根据不同的颜色空间,将字节流数据转换形成二维的图像数据;形成二维图像矩阵的结构可采取固定列、或固定行、或正方形拟合三种方式;运行程序进行转换,基因信息的二进制字节流生成HSV颜色模型,再转换至RGB颜色模型,最后生成JPG格式的可视化图像;其中:将二进制字节流形式的基因信息,根据颜色空间模型,转化形成二维的图像数据;可用的颜色空间模型包括:RGB、HSV、GRAY单通道;其中:形成二维图像矩阵的结构可采取固定列、或固定行、或正方形拟合三种方式:固定列:固定列是指图像的高度采用可设定的固定值,宽度根据不同基因文件的大小而定;固定行:固定行是指图像的宽度采用可设定的固定值,高度根据不同基因文件的大小而定;正方形拟合:正方形拟合法是找到最靠近字节流长度且大于字节流长度的平方数作为图像的面积,图像长宽相等,都等于平方数的开方,不足的色块用固定颜色来进行填充;运行程序进行可视化图像转换,在运用程序进行转换时,每个碱基组得到一个固定的8位二进制数,然后8位二进制数再乘以4作为H色度值,128作为S饱和度值,128作为V亮度值,生成HSV颜色模型,然后再转换成RGB颜色模型,最后生成JPG格式的可视化图像。
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