[发明专利]mRNA信息的二进制存储方法有效
申请号: | 201610383223.X | 申请日: | 2016-05-31 |
公开(公告)号: | CN106055927B | 公开(公告)日: | 2018-08-17 |
发明(设计)人: | 谢清禄;徐宏锴;朱军;余孟春 | 申请(专利权)人: | 广州麦仑信息科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;G06F19/24 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 510665 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供一种mRNA测序后数据信息的二进制表示的存储方法,是涉及生物信息的数据存储的处理技术。该方法将mRNA的四种碱基以字符A、U、G、C表示;将四种碱基利用计算机二进制方法,对每一个碱基进行数值定义并用两位二进制数来表示;密码子由mRNA上的三个相邻碱基组成,密码子通过两位代表法转换之后生成了一个6位的二进制数值,并且可以将这个6位数据存储到一个字节(8位)的高位或低位,剩余的2位数值可用00,01,10,11作为固定值来填充;碱基共有四种组合,所以每个密码子有4^3=64种组合方式。对mRNA的64种密码子进行重新编码,通过mRNA的二进制表示和mRNA信息映射转换都可以将mRNA序列信息存储在一个具有随机存取格式的二进制文件当中。 | ||
搜索关键词: | mrna 信息 二进制 存储 方法 | ||
【主权项】:
1.关于mRNA信息的二进制存储方法,其特征在于,所述的方法包括:根据mRNA单链结构及其与DNA碱基互补配对原则,由字符代表mRNA中的碱基;将四种碱基进行数值定义并用两位二进制数来表示;三个相邻的碱基组成的密码子以6位二进制数值和2位固定赋值组成一个8位的二进制数值表示;以线性映射的方式,将64种密码子0~63根据Y=4X、或Y=4X+1、或Y=4X+2、或Y=4X+3的公式均匀映射到0~255中,并将0~255所有数值转换为8位二进制数,以二进制字节流形式的数据信息进行存储。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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