[发明专利]mRNA信息的二进制存储方法有效

专利信息
申请号: 201610383223.X 申请日: 2016-05-31
公开(公告)号: CN106055927B 公开(公告)日: 2018-08-17
发明(设计)人: 谢清禄;徐宏锴;朱军;余孟春 申请(专利权)人: 广州麦仑信息科技有限公司
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22;G06F19/24
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 510665 广东省广州*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提供一种mRNA测序后数据信息的二进制表示的存储方法,是涉及生物信息的数据存储的处理技术。该方法将mRNA的四种碱基以字符A、U、G、C表示;将四种碱基利用计算机二进制方法,对每一个碱基进行数值定义并用两位二进制数来表示;密码子由mRNA上的三个相邻碱基组成,密码子通过两位代表法转换之后生成了一个6位的二进制数值,并且可以将这个6位数据存储到一个字节(8位)的高位或低位,剩余的2位数值可用00,01,10,11作为固定值来填充;碱基共有四种组合,所以每个密码子有4^3=64种组合方式。对mRNA的64种密码子进行重新编码,通过mRNA的二进制表示和mRNA信息映射转换都可以将mRNA序列信息存储在一个具有随机存取格式的二进制文件当中。
搜索关键词: mrna 信息 二进制 存储 方法
【主权项】:
1.关于mRNA信息的二进制存储方法,其特征在于,所述的方法包括:根据mRNA单链结构及其与DNA碱基互补配对原则,由字符代表mRNA中的碱基;将四种碱基进行数值定义并用两位二进制数来表示;三个相邻的碱基组成的密码子以6位二进制数值和2位固定赋值组成一个8位的二进制数值表示;以线性映射的方式,将64种密码子0~63根据Y=4X、或Y=4X+1、或Y=4X+2、或Y=4X+3的公式均匀映射到0~255中,并将0~255所有数值转换为8位二进制数,以二进制字节流形式的数据信息进行存储。
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