[发明专利]一种蛋白质翻译后修饰甲基化位点的预测方法在审

专利信息
申请号: 201610447108.4 申请日: 2016-06-21
公开(公告)号: CN105893787A 公开(公告)日: 2016-08-24
发明(设计)人: 邱建丁;温平平;施绍萍;梁汝萍 申请(专利权)人: 南昌大学
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 南昌洪达专利事务所 36111 代理人: 刘凌峰
地址: 330031 江西省*** 国省代码: 江西;36
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摘要: 发明公开了一种蛋白质翻译后修饰甲基化位点的预测方法,属于生物信息学领域。蛋白质甲基化修饰参与细胞功能及细胞过程的许多生命活动,识别其位点对理解细胞的生命活动有十分重要的意义。本发明融合序列信息、进化信息和物理化学性质对蛋白质甲基化序列进行特征编码,采用信息增益优化特征方法并结合支持向量机构建预测模型,独立测试结果表明本方法对蛋白质甲基化位点具有良好的预测性能,同时,开发了网络预测平台,用于对蛋白质甲基化位点的在线预测。
搜索关键词: 一种 蛋白质 翻译 修饰 甲基化 预测 方法
【主权项】:
一种蛋白质翻译后修饰甲基化位点的预测方法,其特征在于:首先,收集实验验证的蛋白质甲基化数据,进行序列预处理后得到正负样本序列,对样本序列进行序列信息、进化信息和物理化学性质等三方面的特征编码;然后,采用信息增益方法优化特征,再采用支持向量机进行机器学习和构建预测模型,用评价指标判断预测模型的性能;最后,构建蛋白质甲基化位点网络预测平台,用于蛋白质甲基化位点的在线预测。
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