[发明专利]一种分子标签的制备方法有效

专利信息
申请号: 201610496676.3 申请日: 2016-06-30
公开(公告)号: CN106119356B 公开(公告)日: 2019-09-24
发明(设计)人: 王海龙;胡妮;徐健;唐元华 申请(专利权)人: 首度生物科技(苏州)有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司;合肥首度基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806
代理公司: 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 代理人: 冯瑞
地址: 215123 江苏省苏州市工*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明涉及一种分子标签的制备方法,包括以下步骤:在DNA分子模板的5′接头端引入barcode序列;用DNA聚合酶延伸3′接头端,与barcode序列互补,得到补齐序列;向补齐序列中加入DNA聚合酶,在补齐序列的3′接头端引入胸腺嘧啶,得到改造的接头;将待测DNA破碎成DNA短片段,用DNA连接酶连接DNA短片段与改造的接头,得到DNA连接产物;聚合酶链式反应扩增DNA连接产物,得到扩增产物;对扩增产物进行测序,然后比对到人类参考基因组,在多个DNA模板副本中选取碱基错误率最低的DNA序列,即为分子标签。该分子标签技术通过改变barcode长度,去除固定序列,减少测序中数据的浪费,提高了反应速率,能有效区分DNA扩增过程中的错误和真实的DNA变异。
搜索关键词: 一种 分子 标签 制备 方法
【主权项】:
1.一种分子标签的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)将adapter‑1和adapter‑2均匀混合后进行梯度温度降温退火;所述adapter‑1的序列为5'‑TACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT‑3';所述adapter‑2的序列为5’‑TCTTCTACAGTCANNNNNNAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC‑3’,其中,序列中的NNNNNN为6bp的随机barcode,N表示A、T、G或C中任何一个碱基;或所述adapter‑2的序列为5’‑TCTTCTACAGTCANNAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC‑3’,其中,序列中的NN为2bp的随机barcode,N表示A、T、G或C中任何一个碱基;(2)用Taq DNA聚合酶延伸3′接头端,与barcode序列互补,得到补齐序列;(3)向步骤(2)得到的所述补齐序列中加入Taq DNA聚合酶,在所述补齐序列的3′接头端引入胸腺嘧啶,得到改造的接头;(4)将待测DNA破碎成DNA短片段,用DNA连接酶连接所述DNA短片段与所述改造的接头,得到DNA连接产物;(5)聚合酶链式反应扩增所述DNA连接产物,得到扩增产物;(6)对所述扩增产物进行测序,然后比对到人类参考基因组,在多个DNA模板副本中选取碱基错误率最低的DNA序列。
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