[发明专利]测定微生物群落中已知基因组信息物种的种特异性引物的设计方法及测定菌种含量的方法在审
| 申请号： | 201610552455.3 | 申请日： | 2016-07-14 |
| 公开（公告）号： | CN106222249A | 公开（公告）日： | 2016-12-14 |
| 发明（设计）人： | 张会敏;李凯强;苏立宇;何鸿魁;余秀娟;曹润杰;汤知辉;王伟民;张治洲 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨工业大学(威海) |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司： | 威海科星专利事务所37202 | 代理人： | 丁宏斌 |
| 地址： | 264209*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种测定微生物群落中已知基因组信息物种的种特异性引物的设计方法及测定菌种含量的方法，属于生物技术领域。本发明是一种基于微生物群落中某些已知基因组信息的物种的种特异性引物的设计方法，该设计方法包括近全长的核糖体基因文库克隆测序；生物信息学分析(BLAST等)确定菌群中的物种及其相对丰度；查询已经具备基因组序列的物种；依据PRIMER‑BLAST工具设计物种特异性引物；引物特异性检测。菌种含量测定是通过QPCR方法使用本发明的物种特异性引物，定量测定相应物种在微生物群落中的含量。这种测定微生物群落中已知微生物含量的方法可以在种的层次上跟踪考察某些重要微生物物种在重要生物学过程如白酒发酵过程中的数量变化。本发明是针对某些微生物基因组中物种特异性的非核糖体基因序列的拷贝数的定量方法，而非微生物群落中物种细胞的详细个数。 | ||
| 搜索关键词： | 测定 微生物 群落 已知 基因组 信息 物种 特异性 引物 设计 方法 菌种 含量 | ||
【主权项】：
一种测定微生物群落中已知基因组信息物种的种特异性引物的设计方法，其特征在于：其引物设计按照如下步骤实施：步骤S1，核糖体基因接近全长的文库克隆测序；步骤S2，生物信息学分析(BLAST等)确定菌群中的物种信息以及查询具备基因组序列的物种；步骤S3，使用PRIMER‑BLAST在线工具设计物种特异性引物；步骤S4，引物特异性检测。
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