[发明专利]监测家禽保种效果的SNP标记筛选方法及其在鸡保种上的应用、以及SNP标记的鉴定方法在审
| 申请号： | 201610601296.1 | 申请日： | 2016-07-28 |
| 公开（公告）号： | CN106434867A | 公开（公告）日： | 2017-02-22 |
| 发明（设计）人： | 韩威;苏一军;李国辉;王洪志;朱云芬;盛中伟;张会永;殷建玫;邹剑敏 | 申请（专利权）人： | 江苏省家禽科学研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 北京连和连知识产权代理有限公司11278 | 代理人： | 奚衡宝 |
| 地址： | 225200 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种监测家禽保种效果的高密度SNP分子标记筛选方法及其在鸡种保种上的应用、以及SNP分子标记的鉴定方法。选取若干同类家禽品种，每个家禽品种选取若干个体，按照以下方法筛选SNP：1）所有家禽品种共有，各SNP位点在任一品种中至少存在两个等位基因；2）在基因组上分布相对集中，SNP位点数量在基因组1M 区间内 >90个；3）遗传多样性较为丰富，各SNP位点在任一品种中的最小等位基因频率 >0.1；筛选得到满足上述1）、2）、3）要求的SNP位点。本发明提供一种利用简化基因组RAD‑seq测序技术对不同地方鸡种进行测序，通过序列比对，鉴定出在不同鸡种基因组上集中分布、遗传多样性较为丰富的一致性SNP位点。 | ||
| 搜索关键词： | 监测 家禽 保种 效果 snp 标记 筛选 方法 及其 应用 以及 鉴定 | ||
【主权项】：
监测家禽保种效果的高密度SNP分子标记筛选方法，其特征在于，选取若干同类家禽品种，每个家禽品种选取若干个体，按照以下方法筛选SNP：1）所有家禽品种共有，各SNP位点在任一品种中至少存在两个等位基因；2）在基因组上分布相对集中，SNP位点数量在基因组1M 区间内 >90个；3）遗传多样性较为丰富，各SNP位点在任一品种中的最小等位基因频率 >0.1；筛选得到满足上述1）、2）、3）要求的SNP位点。
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