[发明专利]一种基因调控网络的优化控制方法有效

专利信息
申请号: 201610627176.9 申请日: 2016-08-02
公开(公告)号: CN106295150B 公开(公告)日: 2019-01-08
发明(设计)人: 魏欧;战芸娇;郭宗豪 申请(专利权)人: 南京航空航天大学
主分类号: G06F17/50 分类号: G06F17/50;G06N3/00
代理公司: 南京钟山专利代理有限公司 32252 代理人: 戴朝荣
地址: 210016 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供一种基因调控网络的优化控制方法,包括:在概率模型检测器PRISM中对带有干扰的并且上下文相关的概率布尔网络进行建模,得到基于PRISM的概率布尔网络模型;利用所述PRISM中的reward结构对所述概率布尔网络的状态设置不同的状态回报值,所述状态回报值用于表征控制成本函数和终端成本;确定分别对有限范围和无限范围进行控制成本优化的第一时序逻辑公式和第二时序逻辑公式;将所述基于PRISM的概率布尔网络模型、所述不同的状态回报值以及所述第一时序逻辑公式和第二时序逻辑公式输入所述概率模型检测器PRISM中,得到最优的优化控制结果。本发明提供的一种基因调控网络的优化控制方法,能够在占用较低内存的同时,提高获取最优的优化控制结果的效率。
搜索关键词: 一种 基因 调控 网络 优化 控制 方法
【主权项】:
1.一种基因调控网络的优化控制方法,其特征在于,所述方法包括:在概率模型检测器PRISM中对带有干扰的并且上下文相关的概率布尔网络进行建模,得到基于PRISM的概率布尔网络模型;利用所述PRISM中的reward结构对所述概率布尔网络的状态设置不同的状态回报值,所述状态回报值用于表征控制成本函数和终端成本;确定分别对有限范围和无限范围进行控制成本优化的第一时序逻辑公式和第二时序逻辑公式;将所述基于PRISM的概率布尔网络模型、所述不同的状态回报值以及所述第一时序逻辑公式和第二时序逻辑公式输入所述概率模型检测器PRISM中,得到最优的优化控制结果;所述第一时序逻辑公式为:Rmin=?:[C<=T+1]其中,所述第一时序逻辑公式表示有限范围对应的最小累计回报值,所述累计回报值为每个时刻的控制成本函数值以及终端成本的累加,Rmin表示操作符,C表示累计时间,T表示整数变量,?:表示条件运算符;所述第二时序逻辑公式为:Rmin=?:[Fprop]其中,所述第二时序逻辑公式表示无限范围对应的最小可达性回报值,F表示时序逻辑词,prop表示目标状态。
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