[发明专利]一种野生稻染色体片段置换系的构建方法

摘要

本发明公开了一种野生稻染色体片段置换系(CSSL)的构建方法。本发明构建了能够覆盖全部染色体基因组的置换系群体，且置换系的遗传背景非常清晰，对某一个置换系而言，其遗传背景与受体亲本大致相同，只在某个已知标记区段与供体亲本存在差异，而对全套置换系而言，所有野生稻的染色体片断都有与之对应的标记区段，而且避免了重复和缺失。本发明构建的野生稻染色体片段置换系不仅为建立一个全面进行野生稻基因组学研究的平台提供基础，也为水稻基因组学研究、创新种质资源提供了长期有利的帮助。

主权项

1.一种用于构建野生稻染色体片段置换系的引物组1，所述引物组1由181个引物对组成；所述181个引物对由引物对1‑引物对181组成；所述引物对1由序列1所示的单链DNA分子和序列2所示的单链DNA分子组成；所述引物对2由序列3所示的单链DNA分子和序列4所示的单链DNA分子组成；所述引物对3由序列5所示的单链DNA分子和序列6所示的单链DNA分子组成；所述引物对4由序列7所示的单链DNA分子和序列8所示的单链DNA分子组成；所述引物对5由序列9所示的单链DNA分子和序列10所示的单链DNA分子组成；所述引物对6由序列11所示的单链DNA分子和序列12所示的单链DNA分子组成；所述引物对7由序列13所示的单链DNA分子和序列14所示的单链DNA分子组成；所述引物对8由序列15所示的单链DNA分子和序列16所示的单链DNA分子组成；所述引物对9由序列17所示的单链DNA分子和序列18所示的单链DNA分子组成；所述引物对10由序列19所示的单链DNA分子和序列20所示的单链DNA分子组成；所述引物对11由序列21所示的单链DNA分子和序列22所示的单链DNA分子组成；所述引物对12由序列23所示的单链DNA分子和序列24所示的单链DNA分子组成；所述引物对13由序列25所示的单链DNA分子和序列26所示的单链DNA分子组成；所述引物对14由序列27所示的单链DNA分子和序列28所示的单链DNA分子组成；所述引物对15由序列29所示的单链DNA分子和序列30所示的单链DNA分子组成；所述引物对16由序列31所示的单链DNA分子和序列32所示的单链DNA分子组成；所述引物对17由序列33所示的单链DNA分子和序列34所示的单链DNA分子组成；所述引物对18由序列35所示的单链DNA分子和序列36所示的单链DNA分子组成；所述引物对19由序列37所示的单链DNA分子和序列38所示的单链DNA分子组成；所述引物对20由序列39所示的单链DNA分子和序列40所示的单链DNA分子组成；所述引物对21由序列41所示的单链DNA分子和序列42所示的单链DNA分子组成；所述引物对22由序列43所示的单链DNA分子和序列44所示的单链DNA分子组成；所述引物对23由序列45所示的单链DNA分子和序列46所示的单链DNA分子组成；所述引物对24由序列47所示的单链DNA分子和序列48所示的单链DNA分子组成；所述引物对25由序列49所示的单链DNA分子和序列50所示的单链DNA分子组成；所述引物对26由序列51所示的单链DNA分子和序列52所示的单链DNA分子组成；所述引物对27由序列53所示的单链DNA分子和序列54所示的单链DNA分子组成；所述引物对28由序列55所示的单链DNA分子和序列56所示的单链DNA分子组成；所述引物对29由序列57所示的单链DNA分子和序列58所示的单链DNA分子组成；所述引物对30由序列59所示的单链DNA分子和序列60所示的单链DNA分子组成；所述引物对31由序列61所示的单链DNA分子和序列62所示的单链DNA分子组成；所述引物对32由序列63所示的单链DNA分子和序列64所示的单链DNA分子组成；所述引物对33由序列65所示的单链DNA分子和序列66所示的单链DNA分子组成；所述引物对34由序列67所示的单链DNA分子和序列68所示的单链DNA分子组成；所述引物对35由序列69所示的单链DNA分子和序列70所示的单链DNA分子组成；所述引物对36由序列71所示的单链DNA分子和序列72所示的单链DNA分子组成；所述引物对37由序列73所示的单链DNA分子和序列74所示的单链DNA分子组成；所述引物对38由序列75所示的单链DNA分子和序列76所示的单链DNA分子组成；所述引物对39由序列77所示的单链DNA分子和序列78所示的单链DNA分子组成；所述引物对40由序列79所示的单链DNA分子和序列80所示的单链DNA分子组成；所述引物对41由序列81所示的单链DNA分子和序列82所示的单链DNA分子组成；所述引物对42由序列83所示的单链DNA分子和序列84所示的单链DNA分子组成；所述引物对43由序列85所示的单链DNA分子和序列86所示的单链DNA分子组成；所述引物对44由序列87所示的单链DNA分子和序列88所示的单链DNA分子组成；所述引物对45由序列89所示的单链DNA分子和序列90所示的单链DNA分子组成；所述引物对46由序列91所示的单链DNA分子和序列92所示的单链DNA分子组成；所述引物对47由序列93所示的单链DNA分子和序列94所示的单链DNA分子组成；所述引物对48由序列95所示的单链DNA分子和序列96所示的单链DNA分子组成；所述引物对49由序列97所示的单链DNA分子和序列98所示的单链DNA分子组成；所述引物对50由序列99所示的单链DNA分子和序列100所示的单链DNA分子组成；所述引物对51由序列101所示的单链DNA分子和序列102所示的单链DNA分子组成；所述引物对52由序列103所示的单链DNA分子和序列104所示的单链DNA分子组成；所述引物对53由序列105所示的单链DNA分子和序列106所示的单链DNA分子组成；所述引物对54由序列107所示的单链DNA分子和序列108所示的单链DNA分子组成；所述引物对55由序列109所示的单链DNA分子和序列110所示的单链DNA分子组成；所述引物对56由序列111所示的单链DNA分子和序列112所示的单链DNA分子组成；所述引物对57由序列113所示的单链DNA分子和序列114所示的单链DNA分子组成；所述引物对58由序列115所示的单链DNA分子和序列116所示的单链DNA分子组成；所述引物对59由序列117所示的单链DNA分子和序列118所示的单链DNA分子组成；所述引物对60由序列119所示的单链DNA分子和序列120所示的单链DNA分子组成；所述引物对61由序列121所示的单链DNA分子和序列122所示的单链DNA分子组成；所述引物对62由序列123所示的单链DNA分子和序列124所示的单链DNA分子组成；所述引物对63由序列125所示的单链DNA分子和序列126所示的单链DNA分子组成；所述引物对64由序列127所示的单链DNA分子和序列128所示的单链DNA分子组成；所述引物对65由序列129所示的单链DNA分子和序列130所示的单链DNA分子组成；所述引物对66由序列131所示的单链DNA分子和序列132所示的单链DNA分子组成；所述引物对67由序列133所示的单链DNA分子和序列134所示的单链DNA分子组成；所述引物对68由序列135所示的单链DNA分子和序列136所示的单链DNA分子组成；所述引物对69由序列137所示的单链DNA分子和序列138所示的单链DNA分子组成；所述引物对70由序列139所示的单链DNA分子和序列140所示的单链DNA分子组成；所述引物对71由序列141所示的单链DNA分子和序列142所示的单链DNA分子组成；所述引物对72由序列143所示的单链DNA分子和序列144所示的单链DNA分子组成；所述引物对73由序列145所示的单链DNA分子和序列146所示的单链DNA分子组成；所述引物对74由序列147所示的单链DNA分子和序列148所示的单链DNA分子组成；所述引物对75由序列149所示的单链DNA分子和序列150所示的单链DNA分子组成；所述引物对76由序列151所示的单链DNA分子和序列152所示的单链DNA分子组成；所述引物对77由序列153所示的单链DNA分子和序列154所示的单链DNA分子组成；所述引物对78由序列155所示的单链DNA分子和序列156所示的单链DNA分子组成；所述引物对79由序列157所示的单链DNA分子和序列158所示的单链DNA分子组成；所述引物对80由序列159所示的单链DNA分子和序列160所示的单链DNA分子组成；所述引物对81由序列161所示的单链DNA分子和序列162所示的单链DNA分子组成；所述引物对82由序列163所示的单链DNA分子和序列164所示的单链DNA分子组成；所述引物对83由序列165所示的单链DNA分子和序列166所示的单链DNA分子组成；所述引物对84由序列167所示的单链DNA分子和序列168所示的单链DNA分子组成；所述引物对85由序列169所示的单链DNA分子和序列170所示的单链DNA分子组成；所述引物对86由序列171所示的单链DNA分子和序列172所示的单链DNA分子组成；所述引物对87由序列173所示的单链DNA分子和序列174所示的单链DNA分子组成；所述引物对88由序列175所示的单链DNA分子和序列176所示的单链DNA分子组成；所述引物对89由序列177所示的单链DNA分子和序列178所示的单链DNA分子组成；所述引物对90由序列179所示的单链DNA分子和序列180所示的单链DNA分子组成；所述引物对91由序列181所示的单链DNA分子和序列182所示的单链DNA分子组成；所述引物对92由序列183所示的单链DNA分子和序列184所示的单链DNA分子组成；所述引物对93由序列185所示的单链DNA分子和序列186所示的单链DNA分子组成；所述引物对94由序列187所示的单链DNA分子和序列188所示的单链DNA分子组成；所述引物对95由序列189所示的单链DNA分子和序列190所示的单链DNA分子组成；所述引物对96由序列191所示的单链DNA分子和序列192所示的单链DNA分子组成；所述引物对97由序列193所示的单链DNA分子和序列194所示的单链DNA分子组成；所述引物对98由序列195所示的单链DNA分子和序列196所示的单链DNA分子组成；所述引物对99由序列197所示的单链DNA分子和序列198所示的单链DNA分子组成；所述引物对100由序列199所示的单链DNA分子和序列200所示的单链DNA分子组成；所述引物对101由序列201所示的单链DNA分子和序列202所示的单链DNA分子组成；所述引物对102由序列203所示的单链DNA分子和序列204所示的单链DNA分子组成；所述引物对103由序列205所示的单链DNA分子和序列206所示的单链DNA分子组成；所述引物对104由序列207所示的单链DNA分子和序列208所示的单链DNA分子组成；所述引物对105由序列209所示的单链DNA分子和序列210所示的单链DNA分子组成；所述引物对106由序列211所示的单链DNA分子和序列212所示的单链DNA分子组成；所述引物对107由序列213所示的单链DNA分子和序列214所示的单链DNA分子组成；所述引物对108由序列215所示的单链DNA分子和序列216所示的单链DNA分子组成；所述引物对109由序列217所示的单链DNA分子和序列218所示的单链DNA分子组成；所述引物对110由序列219所示的单链DNA分子和序列220所示的单链DNA分子组成；所述引物对111由序列221所示的单链DNA分子和序列222所示的单链DNA分子组成；所述引物对112由序列223所示的单链DNA分子和序列224所示的单链DNA分子组成；所述引物对113由序列225所示的单链DNA分子和序列226所示的单链DNA分子组成；所述引物对114由序列227所示的单链DNA分子和序列228所示的单链DNA分子组成；所述引物对115由序列229所示的单链DNA分子和序列230所示的单链DNA分子组成；所述引物对116由序列231所示的单链DNA分子和序列232所示的单链DNA分子组成；所述引物对117由序列233所示的单链DNA分子和序列234所示的单链DNA分子组成；所述引物对118由序列235所示的单链DNA分子和序列236所示的单链DNA分子组成；所述引物对119由序列237所示的单链DNA分子和序列238所示的单链DNA分子组成；所述引物对120由序列239所示的单链DNA分子和序列240所示的单链DNA分子组成；所述引物对121由序列241所示的单链DNA分子和序列242所示的单链DNA分子组成；所述引物对122由序列243所示的单链DNA分子和序列244所示的单链DNA分子组成；所述引物对123由序列245所示的单链DNA分子和序列246所示的单链DNA分子组成；所述引物对124由序列247所示的单链DNA分子和序列248所示的单链DNA分子组成；所述引物对125由序列249所示的单链DNA分子和序列250所示的单链DNA分子组成；所述引物对126由序列251所示的单链DNA分子和序列252所示的单链DNA分子组成；所述引物对127由序列253所示的单链DNA分子和序列254所示的单链DNA分子组成；所述引物对128由序列255所示的单链DNA分子和序列256所示的单链DNA分子组成；所述引物对129由序列257所示的单链DNA分子和序列258所示的单链DNA分子组成；所述引物对130由序列259所示的单链DNA分子和序列260所示的单链DNA分子组成；所述引物对131由序列261所示的单链DNA分子和序列262所示的单链DNA分子组成；所述引物对132由序列263所示的单链DNA分子和序列264所示的单链DNA分子组成；所述引物对133由序列265所示的单链DNA分子和序列266所示的单链DNA分子组成；所述引物对134由序列267所示的单链DNA分子和序列268所示的单链DNA分子组成；所述引物对135由序列269所示的单链DNA分子和序列270所示的单链DNA分子组成；所述引物对136由序列271所示的单链DNA分子和序列272所示的单链DNA分子组成；所述引物对137由序列273所示的单链DNA分子和序列274所示的单链DNA分子组成；所述引物对138由序列275所示的单链DNA分子和序列276所示的单链DNA分子组成；所述引物对139由序列277所示的单链DNA分子和序列278所示的单链DNA分子组成；所述引物对140由序列279所示的单链DNA分子和序列280所示的单链DNA分子组成；所述引物对141由序列281所示的单链DNA分子和序列282所示的单链DNA分子组成；所述引物对142由序列283所示的单链DNA分子和序列284所示的单链DNA分子组成；所述引物对143由序列285所示的单链DNA分子和序列286所示的单链DNA分子组成；所述引物对144由序列287所示的单链DNA分子和序列288所示的单链DNA分子组成；所述引物对145由序列289所示的单链DNA分子和序列290所示的单链DNA分子组成；所述引物对146由序列291所示的单链DNA分子和序列292所示的单链DNA分子组成；所述引物对147由序列293所示的单链DNA分子和序列294所示的单链DNA分子组成；所述引物对148由序列295所示的单链DNA分子和序列296所示的单链DNA分子组成；所述引物对149由序列297所示的单链DNA分子和序列298所示的单链DNA分子组成；所述引物对150由序列299所示的单链DNA分子和序列300所示的单链DNA分子组成；所述引物对151由序列301所示的单链DNA分子和序列302所示的单链DNA分子组成；所述引物对152由序列303所示的单链DNA分子和序列304所示的单链DNA分子组成；所述引物对153由序列305所示的单链DNA分子和序列306所示的单链DNA分子组成；所述引物对154由序列307所示的单链DNA分子和序列308所示的单链DNA分子组成；所述引物对155由序列309所示的单链DNA分子和序列310所示的单链DNA分子组成；所述引物对156由序列311所示的单链DNA分子和序列312所示的单链DNA分子组成；所述引物对157由序列313所示的单链DNA分子和序列314所示的单链DNA分子组成；所述引物对158由序列315所示的单链DNA分子和序列316所示的单链DNA分子组成；所述引物对159由序列317所示的单链DNA分子和序列318所示的单链DNA分子组成；所述引物对160由序列319所示的单链DNA分子和序列320所示的单链DNA分子组成；所述引物对161由序列321所示的单链DNA分子和序列322所示的单链DNA分子组成；所述引物对162由序列323所示的单链DNA分子和序列324所示的单链DNA分子组成；所述引物对163由序列325所示的单链DNA分子和序列326所示的单链DNA分子组成；所述引物对164由序列327所示的单链DNA分子和序列328所示的单链DNA分子组成；所述引物对165由序列329所示的单链DNA分子和序列330所示的单链DNA分子组成；所述引物对166由序列331所示的单链DNA分子和序列332所示的单链DNA分子组成；所述引物对167由序列333所示的单链DNA分子和序列334所示的单链DNA分子组成；所述引物对168由序列335所示的单链DNA分子和序列336所示的单链DNA分子组成；所述引物对169由序列337所示的单链DNA分子和序列338所示的单链DNA分子组成；所述引物对170由序列339所示的单链DNA分子和序列340所示的单链DNA分子组成；所述引物对171由序列341所示的单链DNA分子和序列342所示的单链DNA分子组成；所述引物对172由序列343所示的单链DNA分子和序列344所示的单链DNA分子组成；所述引物对173由序列345所示的单链DNA分子和序列346所示的单链DNA分子组成；所述引物对174由序列347所示的单链DNA分子和序列348所示的单链DNA分子组成；所述引物对175由序列349所示的单链DNA分子和序列350所示的单链DNA分子组成；所述引物对176由序列351所示的单链DNA分子和序列352所示的单链DNA分子组成；所述引物对177由序列353所示的单链DNA分子和序列354所示的单链DNA分子组成；所述引物对178由序列355所示的单链DNA分子和序列356所示的单链DNA分子组成；所述引物对179由序列357所示的单链DNA分子和序列358所示的单链DNA分子组成；所述引物对180由序列359所示的单链DNA分子和序列360所示的单链DNA分子组成；所述引物对181由序列361所示的单链DNA分子和序列362所示的单链DNA分子组成。