[发明专利]一种扩增BRCA1/2基因的多重PCR引物及一种多重PCR引物的设计方法有效

专利信息
申请号: 201610737156.7 申请日: 2016-08-26
公开(公告)号: CN106367481B 公开(公告)日: 2019-11-08
发明(设计)人: 张纪斌;王辉云;林钊;李伟琴;罗景燕;赖炳权 申请(专利权)人: 广州永诺健康科技有限公司;广州永诺生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;C40B40/08
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫
地址: 510000 广东省广州市国*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提供了一种扩增BRCA1/2基因的多重PCR引物及一种多重PCR引物的设计方法,所述多重PCR引物包括SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:234所示的核苷酸序列。本发明还提供了一种多重PCR引物的设计方法。本发明提供的多重PCR引物可以快速的完成BRCA1/2目标序列的富集,进而进行NGS文库构建和测序,实现高度自动化、高通量的遗传性乳腺癌BRCA1/2基因检测。
搜索关键词: 一种 扩增 brca1 基因 多重 pcr 引物 设计 方法
【主权项】:
1.一种多重PCR引物的设计方法,其特征在于,所述设计方法包括以下具体步骤:(1)使用引物设计软件设计目标区域的引物库,将目标区域分割成多个小目标区域,所述目标区域为BRCA1/2基因的编码外显子和外显子‑内含子边界10碱基,所述小目标区域的长度控制在200bp以内,然后针对每个小目标区域设计多对引物,构成所述引物库;(2)对步骤(1)设计的引物库中的引物进行筛选,保留特异性强、不包含简单重复序列和不存在高频SNP位点的引物;(3)对于步骤(2)中保留的引物中扩增相同小目标区域的引物,挑选引物设计软件中分值最高的一对引物;(4)在步骤(3)中获得的引物中挑选满足“引物间相互作用最小化”的原则的引物,即得所述多重PCR引物;其中所述“引物间相互作用最小化”的原则为:引物和引物之间3’末端碱基互补数不高于10,引物和引物之间整体互补率不高于75%。
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