[发明专利]一种抗弧菌活性的异香豆素类化合物及其晶体

摘要

本发明属于海洋微生物次级代谢产物领域，具体涉及一种抗弧菌活性的异香豆素类化合物及其晶体，所述异香豆素类化合物具有如下结构：其晶体属于斜方晶系，空间群P2₁2₁2₁，晶胞参数为a＝α＝90°,β＝90°,γ＝90°，Z＝4,D_x＝1.318mg/mm³,F(000)＝640,μ(Cu Kα)＝0.848mm^‑1,2681个可观测点[I>2σ(I)]，可观测点精修最终偏离因子R＝0.083，wR＝0.0707，Flack常数为0.0(3)。本发明所述的异香豆素类化合物及其晶体可用于制备抗菌药物，用于抑制表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、蜡状芽孢杆菌或弧菌等。

主权项

1.一种异香豆素类化合物1的晶体的制备方法，其特征在于步骤如下：(1)红树尖瓣海莲内生真菌Penicillium citrinum HL‑5126的菌种培养菌种培养所用的培养基含有葡萄糖5.0％，重量百分比，下同，酵母膏2％、蛋白胨2％、琼脂3％、粗海盐5.0％，其余为水；使用时制成试管斜面，真菌菌株在25℃下培养5天；(2)红树尖瓣海莲内生真菌Penicillium citrinum HL‑5126的发酵发酵培养所用的培养基含有葡萄糖5.0％，重量百分比，下同，酵母膏2％、蛋白胨2％、氯化钠5％，其余为水；真菌菌株于25℃培养30天；(3)化合物1‑7的提取分离取20L步骤(2)得到的发酵液过滤，除去菌体，将滤液浓缩后，用等体积的乙酸乙酯萃取3次；萃取液浓缩后经过减压硅胶柱层析，采用石油醚‑乙酸乙酯按100:0至0:100梯度洗脱，将其按照极性大小分成5个组分Fr.1～Fr.5；将Fr.3组分以石油醚‑乙酸乙酯10∶2为洗脱剂经正相硅胶柱层析后，再经Sephadex LH‑20凝胶柱层析，洗脱剂为CHCl3∶MeOH＝1∶1，最后经高效液相色谱HPLC制备，色谱柱为Agilent C18,9.4×250mm，7μm，流速为2mL/min，流动相为MeOH∶H2O＝85∶15，最终得到化合物1，5.0mg、化合物2，5.0mg、化合物3，6.2mg、化合物4，6.0mg、化合物5，8.0mg、化合物6，10.0mg、化合物7，7.0mg；(4)取2.0mg化合物1溶于2mL甲醇中，静止自然结晶，4天后得到无色晶体，其晶体结构以双子超衍射仪Xcalibur,Atlas,Gemini ultra diffractometer采用Cu Kα射线，在120.01(10)K下扫描收集衍射数据如下：化合物1晶体：斜方晶系，空间群P2₁2₁2₁，晶胞参数为α＝90°,β＝90°,γ＝90°，Z＝4,D_x＝1.318mg/mm³,F(000)＝640,μ(Cu Kα)＝0.848mm^‑1,2681个可观测点[I>2σ(I)]，可观测点精修最终偏离因子R＝0.083，wR＝0.0707，Flack常数为0.0(3)；所述化合物1‑7的结构如下：