[发明专利]从凝胶电泳条带图像中获取DNA色谱的方法在审

专利信息
申请号: 201610840411.0 申请日: 2016-09-21
公开(公告)号: CN106485698A 公开(公告)日: 2017-03-08
发明(设计)人: 李振庆;赵阳;王林燕;杨波;黄嘉欣;张大伟;山口佳则 申请(专利权)人: 上海理工大学
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06T7/11;G06T7/136
代理公司: 上海申汇专利代理有限公司31001 代理人: 吴宝根
地址: 200093 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及一种从凝胶电泳条带图像中获取DNA色谱的方法,先对采集的电泳条带图像进行灰度转换,依据采用荧光染料,适当提高灰度图中与荧光染料发射波长接近的三基色分量(R,G,B)中某一分量的加权系数,然后通过迭代法计算出灰度图像的最佳阈值,利用阈值进行一次滤波后,对滤波后的图像作对比度增强处理,之后于平行于凝胶条带的方向上提取灰度图像的梯度信息,将其作为特征点并对图像进行二次滤波,将二次滤波后的图像灰度值进行累加得到“凝胶电泳DNA色谱图”。本发明为凝胶电泳成像系统的简化提供了算法支持,自动化的图像处理也节约了实验人员的时间,从而提高了工作效率。
搜索关键词: 凝胶电泳 条带 图像 获取 dna 色谱 方法
【主权项】:
一种从凝胶电泳条带图像中获取DNA色谱的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:1)用手机或相机采集凝胶电泳图像,采集的数字图像送入图像处理算法中;2)利用加权法将采集的真彩图转换为灰度图像;3)使用迭代法求灰度图像的最佳阈值TN;4)利用步骤3)所得最佳阈值TN对步骤2)的灰度图像进行一次滤波,增强图像对比度;5)平行于凝胶条带的方向上提取步骤4)处理后灰度图像的梯度信息,作为特征;6)利用步骤5)所得灰度图像的梯度信息对步骤4)一次滤波后的灰度图像进行图像分割,即对图像进行二次滤波;7)显示结果:对步骤6)二次滤波后图像,于平行凝胶电泳条带方向上,分别将各像素点的灰度级进行累加,并将累加后的数据进行平滑滤波处理,最终以曲线图形式作出“凝胶电泳DNA色谱图”;在“凝胶电泳DNA色谱图”上利用角点检测算法获取各个峰值点的位置,用最小二乘法拟合出“DNA片段大小—迁移位置”关系图。
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