[发明专利]毛蕊花糖苷生物合成途径及其合成酶相关基因在审

专利信息
申请号: 201610849755.8 申请日: 2016-09-26
公开(公告)号: CN106498009A 公开(公告)日: 2017-03-15
发明(设计)人: 周延清;王向楠;段红英;张亮;张丹丹;杨柯 申请(专利权)人: 河南师范大学
主分类号: C12P19/44 分类号: C12P19/44;C12N15/60;C12N15/54;C12N15/53;C12N15/52
代理公司: 新乡市平原专利有限责任公司41107 代理人: 路宽
地址: 453007 *** 国省代码: 河南;41
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摘要: 发明公开了毛蕊花糖苷生物合成途径及其合成酶相关基因,以地黄6个不同发育阶段的块根为材料,提取和检测其总RNA,用Illumina HiSeq2500平台对其组合转录组测序,获得149.8百万reads,从头组装获得96961个Unigenes序列;将Unigenes序列与KEGG数据库比对进行代谢通路分析,获得280个KEGG途径,将代谢通路与推测的毛蕊花糖苷合成途径比对,筛选出5个候选KEGG途径;比较推测的毛蕊花糖苷合成途径和筛选出5个候选KEGG途径,建立有19个基因编码酶催化的毛蕊花糖苷生物合成途径,将Unigenes序列与数据库进行BlastX比对,再附加ESTscan软件功能,得到13个候选的毛蕊花糖苷生物合成酶相关基因。本发明为阐明地黄完整的毛蕊花糖苷生物合成途径和利用次生代谢工程或者合成生物学生产毛蕊花糖苷奠定基础。
搜索关键词: 毛蕊花 糖苷 生物 合成 途径 及其 相关 基因
【主权项】:
毛蕊花糖苷生物合成途径,其特征在于具体过程为:以地黄6个不同发育阶段的块根为材料,提取和检测其总RNA,用Illumina HiSeq2500平台对其组合转录组测序,获得149.8百万reads,从头组装获得96961个Unigenes序列;将上述Unigenes序列与KEGG数据库比对进行代谢通路分析,获得280个KEGG途径,进而将代谢通路与基于稳定同位素标记前体物喂养试验推测的毛蕊花糖苷合成途径比对,筛选出5个候选KEGG途径;比较推测的毛蕊花糖苷合成途径和筛选出5个候选KEGG途径,建立有19个基因编码酶催化的毛蕊花糖苷生物合成途径。
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