[发明专利]一种具有抑制机制的流式生物数据隐私保护增量发布方法有效
申请号: | 201610876549.6 | 申请日: | 2016-10-08 |
公开(公告)号: | CN106570348B | 公开(公告)日: | 2018-11-13 |
发明(设计)人: | 吴响;余文文;李娜娜;沙岩;林童 | 申请(专利权)人: | 徐州医科大学 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20;G06F19/24;G06F21/62 |
代理公司: | 南京钟山专利代理有限公司 32252 | 代理人: | 李小静 |
地址: | 221004 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种具有抑制机制的流式生物数据隐私保护增量发布算法,涉及匿名隐私保护技术领域。本发明基于k‑匿名模型,取出流式生物数据中最早到达的元组s,将其插入到临时存储元组的集合Setw中,等待发布,然后声明一个用于储存抑制元组的集合Sets,再判断Setw中等待时间最长的元组与时延约束δ的关系从而采取抑制机制,换言之,一旦Setw中元组数量大于时延δ且Sets中元组数量小于抑制阈值ε时,将Setw中的ts最小的元组a插入Sets中。该算法利用时延和抑制阈值的思想,以牺牲少量数据为代价换取发布数据的可用性,有效地控制了流式生物数据匿名发布中的信息损失。实验表明:该算法能够有效地匿名化流式生物数据,同时,保证发布的生物数据具有较高可用性。本算法在处理流式生物数据具有显著优势。 | ||
搜索关键词: | 一种 具有 抑制 机制 生物 数据 隐私 保护 增量 发布 算法 | ||
【主权项】:
1.一种具有抑制机制的流式生物数据隐私保护增量发布方法,其特征在于:输入:流式生物数据集S;抑制阈值ε;已发布数据集A;时延约束δ;已发布数据集A的平均距离AD;已发布数据集A的聚类结果m个簇n1,n2,...,nm,其中,任意ni与nj不包含相同的元组,且任意一个元组簇ni中包含元组的数量为2或者3,已发布数据集A中的元组均存在于这m个簇,1≤i≤m,1≤j≤m,且i≠j;输出:更新后的匿名表A';具体步骤如下:1)首先,设有空集合Setw用来存放等待发布的元组,空集合Sets用来存放被抑制的元组;2)当流式生物数据集S非空时,取出流式生物数据集S中ts值最小的元组s,将其插入到Setw中,ts为元组达到收集方的时间;3)若集合Setw中元组个数不大于δ,则执行步骤4);否则,执行步骤6);4)找到集合Setw内距元组s最近的序列r,计算出r和s的距离dist(r,s);5)如果,dist(r,s)小于已发布数据集A的平均距离AD时,从集合Setw取出元组r和s形成的簇放入已发布数据集A中,并泛化r和s,然后执行步骤7);否则,直接执行步骤7);6)若集合Setw中元组个数大于δ,且集合Sets中元组个数小于ε,则将集合Setw中ts最小的元组a移入集合Sets中,然后执行步骤7);若集合Setw中元组个数大于δ,且Sets中元组个数大于ε,则获取集合Setw中ts值最小的元组a,找到已发布数据集A中距离a最近的序列b,将a添加到含b的元组簇ni中;针对新形成的元组簇ni所含元素个数的不同,采取相应处理方式:若此时的ni中元组个数为3时,则泛化ni;若ni中元组个数为4,则把ni划分为元素个数相等的g和h两个簇,并确保两个分组的内部元素距离之和最小,然后泛化g和h;7)跳转到步骤2),直到流式生物数据集S为空;8)得到更新后的匿名表A'。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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