[发明专利]一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记及其应用有效
申请号: | 201610885885.7 | 申请日: | 2016-10-11 |
公开(公告)号: | CN106244719B | 公开(公告)日: | 2019-12-13 |
发明(设计)人: | 冉雪琴;王嘉福;喻昌燕;牛熙 | 申请(专利权)人: | 贵州大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 52100 贵阳中新专利商标事务所 | 代理人: | 吴无惧 |
地址: | 550025 贵州*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | 本发明公开了一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记,其特征在于:结构变异SV141位于猪参考基因组(Ssc 10.2)的chr14:81642733‑81643165,在MCU基因的内含子1内;该结构变异命名为D或A两种基因,三种基因型分别命名为DD、DA和AA型,香猪中D基因的频率显著高于其它6个猪品种,可以作为鉴别香猪品种的分子标记。 | ||
搜索关键词: | 一种 鉴别 品种 结构 变异 sv141 分子 标记 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种鉴别香猪品种的结构变异SV141分子标记,其特征在于:该结构变异长度为433bp,序列为SEQ ID No.3,位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr14:81642734-81643166,在基因MCU内含子1中,将结构变异SV141存在的两种基因命名为缺失型D或正常型A,对应的相应基因型为DD、AA和DA,如果一个样品,只扩增出559bp的一种条带,将基因型定义为DD型;当扩增出559bp和992bp的两种条带,将基因型定义为DA型;如只扩增出992bp一种条带,将基因型定义为AA型,香猪群体以DD和DA为主,香猪群体中D的基因频率明显高于其它6个猪品种,其它猪品种群体之间的D基因频率的差异不大,所述的其它猪品种为可乐猪、江口萝卜猪、糯谷猪、黔北黑猪、荣昌猪和大白猪。/n
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