[发明专利]一种环状RNA引物的设计方法有效
| 申请号： | 201610975640.3 | 申请日： | 2016-11-07 |
| 公开（公告）号： | CN107025385B | 公开（公告）日： | 2023-01-10 |
| 发明（设计）人： | 龚畅;宋尔卫;梁格豪 | 申请（专利权）人： | 中山大学孙逸仙纪念医院 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 刘孟斌 |
| 地址： | 510120 *** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种设计环状RNA引物的方法，目前针对环状RNA设计的背靠背引物并没有统一的规定，常用的方法需要在word文档上对序列做反复的拼接，且还要在primer premier 5软件上算连接点的位置，一方面容易在繁杂的过程中出错，出错又不容易发现，另一方面繁杂的设计过程增加时间负担。而本发明的设计方法简单有效，既节省设计时间，又容易学习不容易出错。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 环状 rna 引物 设计 方法 | ||
【主权项】：
一种环状RNA引物的设计方法，其特征在于，所述设计方法包括以下步骤：(1)在数据库中查找目的环状RNA的DNA序列；(2)取两条查找到的DNA序列，将其中一条DNA序列的3’端与另一条RNA序列的5’端连接，形成一条新的DNA序列；(3)在新的DNA序列上距离步骤(2)中3’端与5’端连接处300个碱基的区域内分别设计目的环状RNA的上游引物和下游引物，所述上游引物位于所述新的DNA序列上所述连接处的上游，所述下游引物位于所述新的DNA序列上所述连接处的下游；(4)将步骤(3)中设计的上游引物和下游引物分别进行BLAST，如果该上游引物和下游引物均不能扩增线性RNA分子，则为最终设计的引物。
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