[发明专利]一种针对单细胞转录组数据的降噪声算法在审

专利信息
申请号: 201611014369.3 申请日: 2016-11-18
公开(公告)号: CN106777870A 公开(公告)日: 2017-05-31
发明(设计)人: 邹欣 申请(专利权)人: 邹欣;上正大(上海)基因生物工程有限公司
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 上海旭诚知识产权代理有限公司31220 代理人: 郑立
地址: 200240 上海市闵行区*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种针对单细胞转录组数据的降噪声算法,涉及分子生物学领域,包括步骤1、计算每一个基因的平均表达水平μ和方差σ2;步骤2、μ和σ2被配置为有以下关系σ2=a0μ2+a1μ;步骤3、已知a0,a1和μ,噪声的方差水平σ02用a0μ2+a1μ来估计;步骤4、建立数据读数筛选准则;步骤5、输出的结果中只包含高可靠的基因表达数值。本发明的优点是可以全自动的判定数据的可靠性,从而找出受噪声影响的大基因表达值读数。这个过程基于统计最优化原则,摒除了人为因素的干扰,从而提高了数据处理效率,降低了信息丢失的可能性。
搜索关键词: 一种 针对 单细胞 转录 数据 噪声 算法
【主权项】:
一种针对单细胞转录组数据的降噪声算法,其特征在于,包括:步骤1、计算每一个基因的平均表达水平μ和方差σ2;步骤2、μ和σ2被配置为有以下关系:σ2=a0μ2+a1μ;步骤3、通过使用回归模型建立μ和σ2之间的关系,从而估计a0,a1的值。基于估计的a0,a1和每一个基因的平均表达水平μ,噪声的方差水平σ02用a0μ2+a1μ来估计;步骤4、建立数据读数筛选准则;步骤5、输出的结果中只包含高可靠的基因表达数值。
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