[发明专利]从头测序方法及装置有效
| 申请号： | 201611019740.5 | 申请日： | 2016-11-14 |
| 公开（公告）号： | CN106770605B | 公开（公告）日： | 2019-03-26 |
| 发明（设计）人： | 杨皓;迟浩;周文婧;何昆;曾文锋;刘超;孙瑞祥;贺思敏 | 申请（专利权）人： | 中国科学院计算技术研究所 |
| 主分类号： | G01N27/62 | 分类号： | G01N27/62 |
| 代理公司： | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人： | 王勇;苏晓丽 |
| 地址： | 100190 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了从头测序方法，其包括将待解析的谱图转化为质谱连接图，统计所述质谱连接图中各条路径的得分，提取路径得分高的前若干条普通路径和修饰路径作为候选肽段，其中，所述普通路径为仅由普通边组的路径，所述修改路径为由普通边和修饰边组成的路径且其中仅包含一条修饰边；以及对于每个候选肽段进行肽谱匹配打分，取肽谱匹配打分最高的候选肽段作为所述谱图对应的肽段。该方法可以支持上千种意外修饰的发现，而且不会对肽段鉴定的速度有较大影响。另外，还可以更细粒度地区分相似肽段序列，改善了肽段鉴定的准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 候选肽 肽段鉴定 修饰边 测序 质谱 肽谱 修饰 匹配 肽段序列 大影响 细粒度 准确率 肽段 解析 转化 统计 发现 | ||
【主权项】：
1.一种从头测序方法，包括：将待解析的谱图转化为质谱连接图，其中所述谱图中每根谱峰被转化为所述质谱连接图的节点，在所述质谱连接图中如果两两节点之间的质量差为氨基酸质量或普通修饰质量，则这两个节点之间连接有普通边，该普通边的打分基于质量大的节点对应的谱峰的强度来确定，如果两两节点之间的质量差为意外修饰质量，则这两个节点之间连接有修饰边，该修饰边的打分基于质量大的节点对应的谱峰的强度来确定；统计所述质谱连接图中各条路径的得分，提取路径得分高的前若干条普通路径和修饰路径作为候选肽段，其中，所述普通路径为仅由普通边组的路径，所述修饰路径为由普通边和修饰边组成的路径且其中仅包含一条修饰边；对于每个候选肽段进行肽谱匹配打分，取肽谱匹配打分最高的候选肽段作为所述谱图对应的肽段。
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