[发明专利]一种基于GEMMA的GWAS分析方法及装置在审
| 申请号： | 201611039234.2 | 申请日： | 2016-11-21 |
| 公开（公告）号： | CN106557657A | 公开（公告）日： | 2017-04-05 |
| 发明（设计）人： | 谢华;于洋;徐摇光 | 申请（专利权）人： | 北京市农林科学院 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人： | 关畅,孙楠 |
| 地址： | 100097 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于GEMMA的GWAS分析方法及装置，其特征在于包括将vcf文件一次性转换为GEMMA所需的bim、fam、bed文件；将所得bim,bed,fam文件通过GEMMA进行关联分析；对关联分析后的结果分别进行制作曼哈顿图、QQ图和SNP注释文件，完成GWAS分析。本发明将vcf文件和表型文件作为输入，一次性生成GWAS分析结果，大大提高了分析效率，使GWAS分析更加快捷，简单。使基于GEMMA的GWAS流程一体化，能灵活的分三个模块进行操作，也可一次性输入参数以执行整个流程，分析参数的调整十分灵活。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 gemma gwas 分析 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种基于GEMMA的GWAS分析方法，其特征在于包括以下步骤：1)将vcf文件一次性转换为GEMMA所需的bim、fam、bed文件；2)将所得bim,bed,fam文件通过GEMMA进行关联分析；3)对关联分析后的结果分别进行制作曼哈顿图、QQ图和SNP注释文件，完成GWAS分析。
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