[发明专利]一种马铃薯M病毒基因组全序列及其应用有效

专利信息
申请号: 201611082352.1 申请日: 2016-11-30
公开(公告)号: CN106701799B 公开(公告)日: 2019-11-12
发明(设计)人: 董家红;苏晓霞;吴阔;张仲凯;张丽珍 申请(专利权)人: 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
主分类号: C12N15/40 分类号: C12N15/40;C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C07K16/10
代理公司: 昆明知道专利事务所(特殊普通合伙企业) 53116 代理人: 姜开侠;姜开远
地址: 650223*** 国省代码: 云南;53
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摘要: 发明公开了一种马铃薯M病毒基因组全序列及其应用。核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示或其反义序列。应用为所述的核酸分子用于制备检测马铃薯M病毒的引物、探针或试剂盒,或用于制备抗马铃薯M病毒的抗体。发明人通过常规的病样总RNA的提取和利用多对简并引物进行RT‑PCR扩增、测定了侵染云南马铃薯的马铃薯M病毒基因组全序列。分析发现其基因组为线状、单链正义RNA,不含poly(A)全长8530nt,含6个开读框(ORF),具香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)典型结构特征。其中病毒编码的223kDa、25kDa、12 kDa、7 kDa、34 kDa(外壳蛋白)、11kDa蛋白与其分离物的核苷酸同源性分别低于72%、75.1%、71.6%、59.1%、94.6%、97%,根据病毒株系分类标准,马铃薯M病毒云南马铃薯分离物属于一个远缘株系。
搜索关键词: 马铃薯M病毒 基因组全序列 核酸分子 分离物 制备 马铃薯 应用 核苷酸同源性 核苷酸序列 病毒编码 病毒株系 典型结构 反义序列 分类标准 简并引物 潜隐病毒 外壳蛋白 正义RNA 常规的 基因组 试剂盒 总RNA 病样 单链 抗体 侵染 探针 线状 引物 远缘 株系 蛋白 检测 发现 分析
【主权项】:
1.一种分离的核酸分子,其特征在于所述核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示或其反义序列。
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