[发明专利]基因聚类方法和基于该方法的宏基因组组装方法和装置有效
| 申请号： | 201611090611.5 | 申请日： | 2016-12-01 |
| 公开（公告）号： | CN108133122B | 公开（公告）日： | 2020-09-15 |
| 发明（设计）人： | 覃友文;高强;梁文颖;张义;杨林峰 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 孙银行;彭家恩 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基因聚类方法和基于该方法的宏基因组组装方法和装置，所述基因聚类方法包括：根据每个基因序列或小基因簇在多个样品中的丰度谱，以及每个大基因簇在多个样品中的丰度谱，通过多元线性回归，计算每个大基因簇与每个基因序列或小基因簇的相关性；找到与每个大基因簇的相关性大于设定值的基因序列或小基因簇，并将所找到的基因序列或小基因簇合并至相关联的大基因簇中，组合成新的大基因簇。能够找到多个基因序列或小基因簇的多个源头大基因簇，弥补现有方法的不足，从而增加基因簇的大小，并且获得更好的基因组草图。 | ||
| 搜索关键词： | 基因 方法 基于 宏基 组装 装置 | ||
【主权项】：
一种基因聚类方法，其特征在于，所述方法用于将多个基因序列或小基因簇聚类到多个大基因簇中，其中所述基因簇是指一组有相同来源的基因集合，所述小基因簇是指基因数量小于预设值的基因集合，所述大基因簇是指基因数量大于所述预设值的基因集合；所述方法包括：根据每个所述基因序列或小基因簇在多个样品中的丰度谱，以及每个所述大基因簇在所述多个样品中的丰度谱，通过多元线性回归，计算每个所述大基因簇与每个所述基因序列或小基因簇的相关性；找到与每个所述大基因簇的相关性大于设定值的基因序列或小基因簇，并将所找到的基因序列或小基因簇合并至相关联的大基因簇中，组合成新的大基因簇。
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