[发明专利]一种分析处理农作物SSR标记图谱的方法及其装置

摘要

本发明涉及一种分析处理农作物SSR标记图谱的方法及其装置，其中所述方法包括曲线处理、内标校准以及片段分析和基因分型3个主要处理步骤，其特征在于,片段分析处理中还包括连续多峰处理步骤，所述连续多峰处理包括连续多峰识别、N+1峰识别、N+1峰识别、N+1峰处理、N+1峰再识别、递增多峰识别、递增多峰处理和影子峰处理；所述装置包括曲线处理、内标校准以及片段分析和基因分型3个模块，其特征在于，片段分析和基因分型模块还包括连续多峰处理子模块。本发明提供的分析处理农作物SSR图谱的方法大大改善了SSR标记的指纹采集效果，特别是对2bp的SSR标记类型的读取准确性大大提高。

主权项

一种分析处理农作物SSR标记图谱的装置，所述装置包括曲线处理、内标校准以及片段分析和基因分型3个模块，其特征在于，片段分析和基因分型模块包括连续多峰处理子模块，所述连续多峰处理子模块包括以下单元：连续多峰识别单元，用于识别所处理图谱是否存在连续多峰；N+1峰组识别单元，用于识别连续多峰是否存在N+1峰组，即从连续多峰的第一个峰开始，如果后峰与本峰的间距不大于1.2bp则将后峰加入至N+1峰组；N+1峰组分子组单元，用于将被识别出的N+1峰组进行分子组处理，即在N+1峰组中找到最高的峰，如果最高峰在N+1峰组前3个位置则将最高峰、最高峰的左侧峰及最高峰的右侧的两个峰分为一子组而其他峰为另一子组，反之则将最高峰左侧第一峰、最高峰及最高峰右侧所有峰分为一子组，而其他峰为另一子组；N+1峰组处理单元，用于将经分子组处理后的N+1峰组进行处理，即以每子组的最高峰为基础进行间隔过滤，即将每子组中最高峰两侧的第2n‑1峰排除，其中n为整数且大于0；N+1峰组再识别单元，用于识别经N+1峰组处理单元处理后的图谱是否还存在N+1峰组，若还存在N+1峰组即将图谱传送至N+1峰组分子组单元再次进行分子组处理，若处理后的连续多峰段只剩一峰则结束连续多峰处理，若与上述两个情况不符则进入递增多峰识别单元；递增多峰识别单元，用于识别图谱是否存在递增多峰，即从连续多峰的第一个峰开始作为本峰，若满足Hf<Hb<xHf，或满足yHf<Hb<Hf，将后峰加入递增多峰组，直至本峰为该连续多峰中的最高峰，其中Hf为本峰峰高，Hb为后峰峰高，5≤x≤10，0.85≤y<1；递增多峰处理单元，用于处理被识别出的递增多峰，即若递增多峰组内峰数大于2，将组内其他峰排除只保留最后一峰，并将其他各峰的峰高叠加至最后一峰，处理后结束连续多峰处理，反之则不做处理并进入影子峰处理单元；影子峰处理单元，用于识别并处理被识别出的图谱中的影子峰，即若左峰小于右峰的左比例则将左峰排除，若右峰小于左峰的右比例则将右峰排除，结束连续多峰处理步骤，其中所述左比例和右比例的取值在0至1之间。