[发明专利]一种分析处理农作物荧光毛细管电泳图谱的方法

摘要

本发明涉及一种分析处理农作物荧光毛细管电泳图谱的方法及其装置，所述方法包括曲线处理、内标校准、片段分析和基因分型3个主要处理步骤，其特征在于,曲线处理中还包括拔起峰处理，所述拔起峰处理步骤包括重合峰定位、重合峰分组、重合峰处理、准拔起峰分组、准拔起峰再分组、拔起峰III判断和拔起峰III处理；所述装置包括曲线处理、内标校准、片段分析和基因分型3个模块，其特征在于,曲线处理模块中还包括拔起峰处理子模块。本发明可以有效避免由于内标标准峰位置的峰被删除而造成的内标校准偏差问题，使农作物荧光毛细管电泳图谱的测序准确率得到明显提升，有利于多实验室共同协作建设农作物遗传信息指纹库。

主权项

一种分析处理农作物荧光标记检测图谱的装置，所述装置包括曲线处理、内标校准以及片段分析和基因分型3个模块，其特征在于，曲线处理模块中包括拔起峰处理子模块，所述拔起峰处理模块包括以下单元：重合峰定位单元，用于将A色带与B色带做对比，荧光标记检测图谱上有两种不同颜色的荧光波谱，其中信号较强的波谱为A色带，信号较弱的波谱为B色带，找到B色带中位置与A色带峰的位置重合的峰，将这些峰定为重合峰，其中A色与B色荧光光谱有重叠并且A色带会造成B色带拔起；重合峰分组单元，用于对重合峰分组，具体为：当定位单元所定位的重合峰的位置与内标标准峰位置重合时，本单元将这些重合峰定位拔起峰I，当重合峰的位置既不在连续多峰段又不与内标标准峰重合时，本单元将这些重合峰定位拔起峰II，当重合峰位于连续多峰段时，本单元将这些位于连续多峰段的重合峰定为准拔起峰；重合峰处理单元，用于分别处理分组后的重合峰，具体为：记录各个拔起峰I的位置以供后续内标校准模块参考并消除拔起峰I，消除拔起峰II，记录准拔起峰的总个数N以及各个准拔起峰的位置XiB，其中，i是不小于0且不大于N的整数，当N为0时，结束拔起峰处理；准拔起峰分组单元，用于对准拔起峰进行分组，具体为：将位置为XiB±32帧的所有B色带内的峰分为第i组；准拔起峰再分组单元，用于对准拔起峰进行进一步分组，具体为：准拔起峰分组单元处理后的N个组进行再分组，即找到每组中的最高峰，将最高峰及其左右两峰分为这个组的一个子组1i，组内的其他峰分为另一子组2i；拔起峰III判断单元，用于对准拔起峰的判断，具体为：准拔起峰再分组单元确定的每隔ai子组内，a）将子组位置范围内A色带的峰的峰高排序并将这个范围内的最高峰的位置定位XaiA，另外将子组内最高峰的位置定位XaiB，b）将XaiA与XaiB对比，若XaiA≠BaiB，子组ai中的所有峰都被判断为不是拔起峰III，反之则进行下一步判断，c）当位置为XaiB的峰的峰高HaiB与位置为XaiA的峰的峰高HaiA之间的比例大于c时，位置为XaiB的峰被判断为拔起峰III，其中c的取值依据被测物种调整，d）按照步骤a）b）c），根据峰的位置和峰的高度判断子组ai中其他峰是否为拔起峰III，e）当子组ai中拔起峰III的个数与子组ai中的所有峰的个数的比例低于0.75时，子组ai中的所有峰都被判定为都不是拔起峰III，反之则都是拔起峰III，其中a为子组峰，a取值为1或2；拔起峰III处理单元，用于将拔起峰III消除，并在其后结束拔起峰处理。