[发明专利]高通量测序数据质量过滤方法和过滤装置有效
| 申请号： | 201611236128.3 | 申请日： | 2016-12-28 |
| 公开（公告）号： | CN106777262B | 公开（公告）日： | 2020-07-03 |
| 发明（设计）人： | 陈晨;王震;于伟文 | 申请（专利权）人： | 上海华点云生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G06F16/174 | 分类号： | G06F16/174;G06F16/182;G16B15/00 |
| 代理公司： | 北京邦信阳专利商标代理有限公司 11012 | 代理人： | 金玺 |
| 地址： | 200335 上海*** | 国省代码： | 上海;31 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种对高通量测序数据进行质量过滤的方法和装置，所述方法包括：根据所述高通量测序数据为并行计算做准备；通过并行计算过滤掉准备好的数据中质量不达标的数据。确定质量转换方式；数据切分；生成并行计算的执行实体。将第一文件和第二文件分别转换为第一RDD和第二RDD；将第一RDD和第二RDD分别切分为第一partition组和第二partition组；将第一RDD和第二RDD合并为第三RDD；将第三RDD切分为第三partition组。生成对第三partition组进行并行计算的执行实体task。采用本发明的技术方案，能够大大提高对高通量测序数据进行质量过滤的执行速度。 | ||
| 搜索关键词： | 通量 序数 质量 过滤 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种对高通量测序数据进行质量过滤的方法，其特征在于，所述方法包括：根据所述高通量测序数据为并行计算做准备；通过并行计算过滤掉准备好的数据中质量不达标的数据。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海华点云生物科技有限公司，未经上海华点云生物科技有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201611236128.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：基于多源异构数据集的数据查询方法及装置
- 下一篇：交互信息显示方法及系统
